More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1259 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  100 
 
 		 335 aa  679    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  77.91 
 
 		 335 aa  557  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  79.4 
 
 		 335 aa  557  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  77.31 
 
 		 338 aa  553  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  47.92 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0170  acetyl-lysine deacetylase  35.21 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000443828  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.65 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0317  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  30.41 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1139  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.2 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0335688  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0451  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  34 
 
 		 346 aa  137  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0776  acetyl-lysine deacetylase  31.3 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.689856 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0324  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  30.77 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1498  acetyl-lysine deacetylase  31.27 
 
 		 358 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2180  acetyl-lysine deacetylase  29.89 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.749889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3459  acetyl-lysine deacetylase  29.21 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0027  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  30.59 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0347  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  30.43 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2723  acetyl-lysine deacetylase  29.66 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3310  acetyl-lysine deacetylase  29.5 
 
 		 351 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6288  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.67 
 
 		 361 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1391  acetyl-lysine deacetylase  29.94 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.971431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1757  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.46 
 
 		 383 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2612  acetyl-lysine deacetylase  29.31 
 
 		 387 aa  106  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.880671  normal  0.701984 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.2 
 
 		 378 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  36.28 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0275  acetylornithine deacetylase  30.97 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141091  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0789  peptidase M20  34.71 
 
 		 381 aa  92.8  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  28.12 
 
 		 379 aa  92.4  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  23.82 
 
 		 391 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.76 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  30.43 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.96 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3165  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.25 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.608359 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 405 aa  87  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3178  peptidase M20  27.3 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.87 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  28.34 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.24 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.43 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.43 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1085  peptidase M20  25.7 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000939958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.97 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.21 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.53 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  31.31 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0989  peptidase M20  26.07 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  28.25 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  28.67 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  26.67 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  25.55 
 
 		 387 aa  75.9  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.91 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  26.75 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  26.73 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0672  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.46 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.573003  normal  0.0211089 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  22.79 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  26.65 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.53 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  25.39 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  25.16 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.25 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  21.15 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  23.27 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  26.73 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.47 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.92 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  25.85 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  23.4 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  24.69 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  26.11 
 
 		 380 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.87 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.68 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  25.69 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  24.68 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  23.71 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  24.68 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.9 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.99 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  26.78 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  24.68 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  24.68 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  24.45 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  24.68 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04910  acetylornithine deacetylase  27.54 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  22.96 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  24.68 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  26.85 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4525  acetylornithine deacetylase  22.96 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000031235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.76 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  22.96 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  22.96 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3363  acetylornithine deacetylase  30.39 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288283  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  22.96 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  28.99 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  24.35 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  24.06 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05749  putative acetylornithine deacetylase (Eurofung)  26.01 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0187608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  25.08 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  27.59 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>