66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2528 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  92.34 
 
 		 234 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  73.68 
 
 		 233 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  69.08 
 
 		 233 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  68.6 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  68.12 
 
 		 233 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  69.27 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  67.63 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  50.73 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  48.57 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  42.64 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  39.38 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  40.11 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  37.11 
 
 		 252 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  36.56 
 
 		 241 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  39.77 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  38.05 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  40.35 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  37.5 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  39.89 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  37.7 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  34.64 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  34.64 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  36.63 
 
 		 658 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  36.73 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  40.52 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  35.9 
 
 		 249 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  34.8 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  36.51 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  37.32 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0331  hypothetical protein  31.54 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1423  hypothetical protein  27.75 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108069  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1046  putative transmembrane protein of unknown function  27.75 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.650406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10129  transmembrane protein  27.68 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0181  hypothetical protein  30.87 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534704  normal  0.624731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  25.57 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  26.55 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  31.96 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  31.96 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  27.86 
 
 		 386 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  32.46 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3703  protein of unknown function DUF1275  29.44 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257244  normal  0.181196 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4780  protein of unknown function DUF1275  29.44 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.928873 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6064  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.667221  hitchhiker  0.000289526 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1016  hypothetical protein  23.81 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115286  hitchhiker  0.00109091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6265  hypothetical protein  25.34 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6559  hypothetical protein  26.04 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1272  hypothetical protein  26.04 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1206  protein of unknown function DUF1275  27.31 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6551  hypothetical protein  25.51 
 
 		 252 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6165  hypothetical protein  27.04 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337917  normal  0.0183639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1151  protein of unknown function DUF1275  27.81 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5857  hypothetical protein  27.95 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7065  hypothetical protein  27.04 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559388  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1589  hypothetical protein  29.25 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1532  protein of unknown function DUF1275  25.62 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1506  protein of unknown function DUF1275  30.81 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.128269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  26.26 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2051  hypothetical protein  26.13 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2095  hypothetical protein  30.95 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00423191  normal  0.636208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1535  protein of unknown function DUF1275  29.71 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.297465 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6146  membrane protein  29.73 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3877  hypothetical protein  28.35 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0107  protein of unknown function DUF1275  25.97 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  27.08 
 
 		 386 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00757  hypothetical protein  28.3 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0577476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>