236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6086 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  100 
 
 		 387 aa  731    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  97.42 
 
 		 387 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  82.49 
 
 		 382 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  73.53 
 
 		 381 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  72.87 
 
 		 379 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  73.26 
 
 		 379 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  73.26 
 
 		 379 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  74.33 
 
 		 379 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  72.41 
 
 		 377 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  69.44 
 
 		 382 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  68.16 
 
 		 382 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  42.15 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 385 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 386 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 383 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  33.85 
 
 		 404 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 389 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 388 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  33.06 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  33.06 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  33.06 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  33.06 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  31.41 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 376 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  30.3 
 
 		 380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  31.5 
 
 		 380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 375 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 394 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 381 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 412 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 412 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  27.66 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  23.42 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  28.23 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  25.68 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  28.23 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  28.66 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  28.66 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  21.28 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  28.66 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  25.69 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  25.69 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  25.41 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>