174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3093 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3093  transport protein  100 
 
 		 381 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935055  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09320  transporter, MFS superfamily  74.08 
 
 		 379 aa  431  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00863516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01929  transport protein  53.58 
 
 		 402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001064  vibrioferrin membrane-spanning transport protein PvsC  40.63 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3138  major facilitator superfamily MFS_1  44.62 
 
 		 385 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4784  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 393 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1277  major facilitator transporter  56.29 
 
 		 437 aa  169  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0719  transport protein  41.99 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  30.37 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  27.3 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  27.3 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  27.3 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  27.3 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  27.3 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.86 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  38.64 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  27.22 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0636  hypothetical protein  32.73 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  28.98 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  33.93 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  41.77 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  41.77 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  41.77 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  41.77 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  41.77 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  31.16 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  33.64 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  32.86 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  32.86 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  31.82 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  32.86 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0999  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 430 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.77003  normal  0.0952773 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  33.94 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  35.9 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  33.33 
 
 		 501 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 397 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  30 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 423 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  31.58 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 407 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  33.33 
 
 		 515 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3948  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.81 
 
 		 524 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448257  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  32.95 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87422  MFS family transporter: multidrug efflux  29.61 
 
 		 477 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  34.65 
 
 		 487 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  26.54 
 
 		 415 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 414 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 413 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  27.52 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  22.12 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0773  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 518 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 395 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  28.44 
 
 		 398 aa  49.7  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 488 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  25.19 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 484 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  32.11 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1279  hypothetical protein  24.81 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.06 
 
 		 487 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 406 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 428 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>