114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57505 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  100 
 
 		 668 aa  1347    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  63.88 
 
 		 679 aa  852    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  62.95 
 
 		 668 aa  857    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  39.82 
 
 		 692 aa  535  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  40.4 
 
 		 680 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.811341 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  34.85 
 
 		 693 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  34.85 
 
 		 724 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  31.64 
 
 		 699 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  30.13 
 
 		 674 aa  331  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  29.31 
 
 		 709 aa  313  4.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  29.09 
 
 		 704 aa  296  9e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  29.7 
 
 		 659 aa  295  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  29.54 
 
 		 643 aa  286  7e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  30.52 
 
 		 658 aa  284  4.0000000000000003e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  22.1 
 
 		 587 aa  85.9  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  24.38 
 
 		 556 aa  83.2  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  23.87 
 
 		 596 aa  81.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  21.64 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  22.94 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  22.25 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  20.4 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  22.2 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  26.62 
 
 		 474 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  19.64 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  25 
 
 		 545 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.11 
 
 		 593 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  20.36 
 
 		 556 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  21.51 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  21.04 
 
 		 488 aa  62  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  21.48 
 
 		 564 aa  61.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  26.41 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  22.27 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  24.39 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  22.24 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  23.58 
 
 		 575 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.82 
 
 		 567 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  22.15 
 
 		 483 aa  56.2  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  21.53 
 
 		 461 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  23.64 
 
 		 562 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  22.33 
 
 		 507 aa  56.2  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  23.11 
 
 		 592 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  21.93 
 
 		 537 aa  55.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  22.27 
 
 		 570 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.35 
 
 		 530 aa  55.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  23.03 
 
 		 500 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  21.96 
 
 		 539 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.73 
 
 		 497 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  21.33 
 
 		 479 aa  52.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  24.04 
 
 		 587 aa  52.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  21.18 
 
 		 527 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  20.52 
 
 		 597 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  21.06 
 
 		 529 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  24.12 
 
 		 483 aa  51.2  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  23.97 
 
 		 476 aa  51.6  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  21.51 
 
 		 482 aa  51.6  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  21.92 
 
 		 478 aa  50.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  23.69 
 
 		 541 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  19.91 
 
 		 482 aa  50.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  23.2 
 
 		 488 aa  50.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.97 
 
 		 541 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  24.22 
 
 		 544 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  23.59 
 
 		 568 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  20.63 
 
 		 598 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  24.58 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  23.42 
 
 		 541 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  19.91 
 
 		 483 aa  49.7  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  24.26 
 
 		 495 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  26.42 
 
 		 504 aa  48.9  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.67 
 
 		 522 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2163  Na+/solute symporter  21.66 
 
 		 459 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233045 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  23.63 
 
 		 518 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  21.35 
 
 		 478 aa  48.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  36.92 
 
 		 483 aa  48.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  21.21 
 
 		 562 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  27.14 
 
 		 599 aa  47.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  25.25 
 
 		 498 aa  47.8  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  20.31 
 
 		 479 aa  47.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  22.89 
 
 		 460 aa  47.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.87 
 
 		 542 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  26.85 
 
 		 483 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  23.28 
 
 		 497 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.74 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  26.85 
 
 		 483 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  24.9 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  26.85 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  26.85 
 
 		 483 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  22.57 
 
 		 585 aa  46.6  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  22.72 
 
 		 638 aa  46.6  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  32.76 
 
 		 483 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  32.76 
 
 		 483 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  32.76 
 
 		 483 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  23.15 
 
 		 493 aa  46.2  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.08 
 
 		 484 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  20.54 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  24.38 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  23.63 
 
 		 493 aa  45.8  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  36.21 
 
 		 483 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  19.55 
 
 		 471 aa  45.4  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  24.83 
 
 		 502 aa  45.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  22.13 
 
 		 483 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>