141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33956 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  100 
 
 		 800 aa  1639    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  48.39 
 
 		 772 aa  501  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02920  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  34.6 
 
 		 911 aa  372  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  33 
 
 		 743 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  34.39 
 
 		 751 aa  340  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  33.02 
 
 		 727 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  32.26 
 
 		 757 aa  336  7.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  36.23 
 
 		 725 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  35.32 
 
 		 678 aa  301  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  35.08 
 
 		 712 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  34.14 
 
 		 884 aa  287  7e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  34.14 
 
 		 734 aa  261  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80203  vacuolar targeting protein  24.01 
 
 		 896 aa  167  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.397004  normal  0.0921162 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72031  glutamated carboxypeptidase  29.6 
 
 		 847 aa  166  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.585457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  31.05 
 
 		 1103 aa  63.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  30.8 
 
 		 497 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  41.3 
 
 		 552 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  24.37 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  48.05 
 
 		 539 aa  62.4  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  27.55 
 
 		 545 aa  62  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  31.71 
 
 		 512 aa  60.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  39.29 
 
 		 598 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  31.37 
 
 		 557 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  26.52 
 
 		 512 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  31.37 
 
 		 557 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  47.44 
 
 		 525 aa  60.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  31.76 
 
 		 558 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  33.91 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  31.76 
 
 		 558 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  31.76 
 
 		 558 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  31.37 
 
 		 557 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  27.09 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  33.94 
 
 		 563 aa  58.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  31.33 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  30.86 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  40 
 
 		 454 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  27.78 
 
 		 548 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  24.69 
 
 		 440 aa  56.2  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  29.5 
 
 		 487 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  38.46 
 
 		 559 aa  56.6  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  34.71 
 
 		 542 aa  55.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  37.61 
 
 		 525 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  38.18 
 
 		 334 aa  55.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  37.7 
 
 		 531 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  28.81 
 
 		 552 aa  55.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  35.35 
 
 		 546 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  30.59 
 
 		 522 aa  54.7  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  32.11 
 
 		 338 aa  54.7  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  23.06 
 
 		 440 aa  54.3  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  42.35 
 
 		 544 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  28.82 
 
 		 528 aa  53.9  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  34.71 
 
 		 674 aa  53.9  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  32.41 
 
 		 477 aa  53.9  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  31.82 
 
 		 481 aa  53.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  35.51 
 
 		 533 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  33.33 
 
 		 534 aa  53.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  34.27 
 
 		 523 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  36.56 
 
 		 468 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  41.25 
 
 		 467 aa  52.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  36.84 
 
 		 553 aa  52.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  33.94 
 
 		 466 aa  51.6  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  27.97 
 
 		 552 aa  51.6  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  29.79 
 
 		 775 aa  51.6  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  26.53 
 
 		 549 aa  51.2  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  35.96 
 
 		 556 aa  51.2  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  36.56 
 
 		 468 aa  51.2  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  33.33 
 
 		 519 aa  51.2  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  34.86 
 
 		 407 aa  50.8  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  27.19 
 
 		 529 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  35.48 
 
 		 468 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  41.84 
 
 		 677 aa  50.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  35.48 
 
 		 469 aa  50.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  35.64 
 
 		 524 aa  50.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  35.48 
 
 		 468 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  36.36 
 
 		 473 aa  50.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  31.86 
 
 		 536 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  34.65 
 
 		 501 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  38.6 
 
 		 569 aa  50.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  33.73 
 
 		 548 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  35.48 
 
 		 468 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  24.08 
 
 		 438 aa  50.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  40.74 
 
 		 526 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  33.33 
 
 		 550 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  35.48 
 
 		 468 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  36.04 
 
 		 537 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  41.89 
 
 		 401 aa  48.9  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  36.25 
 
 		 578 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  31.86 
 
 		 535 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  38.37 
 
 		 463 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  36.84 
 
 		 401 aa  48.5  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  33.33 
 
 		 518 aa  48.5  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  36.08 
 
 		 472 aa  48.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  37.5 
 
 		 468 aa  48.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  26.5 
 
 		 466 aa  48.1  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  43.08 
 
 		 468 aa  48.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  32.38 
 
 		 502 aa  48.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  30.09 
 
 		 555 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  38.64 
 
 		 341 aa  48.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  34.41 
 
 		 468 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  38.37 
 
 		 458 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>