55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0186 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0186  lipoprotein RagB  100 
 
 		 501 aa  1035    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.463623 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0785  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 511 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  29.53 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  27.21 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  23.24 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  27.39 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  24.93 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1551  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 483 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 477 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 487 aa  54.3  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 491 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  21.14 
 
 		 542 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  22.67 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  24.74 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  23.02 
 
 		 491 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  24.92 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 493 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  25.78 
 
 		 466 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  21.05 
 
 		 504 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1575  hypothetical protein  25.7 
 
 		 541 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.0694567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  37.18 
 
 		 561 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 549 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  24.56 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 491 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  22.14 
 
 		 530 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 482 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  22.54 
 
 		 507 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  24.73 
 
 		 456 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  25.37 
 
 		 492 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2110  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 476 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 479 aa  47  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  24.36 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  22.57 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  28.37 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 579 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  24.44 
 
 		 507 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  34.21 
 
 		 555 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 494 aa  43.9  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  24.27 
 
 		 467 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 462 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 448 aa  43.9  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  23.42 
 
 		 494 aa  43.5  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 488 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  22.4 
 
 		 534 aa  43.5  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  23.84 
 
 		 454 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>