More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3665 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  46.49 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  43.7 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 130 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 245 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 242 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 132 aa  94.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  42.11 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  41.88 
 
 		 242 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  41.53 
 
 		 242 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  36.36 
 
 		 235 aa  91.3  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 245 aa  90.9  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0162  response regulator receiver domain-containing protein  41.59 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  41.96 
 
 		 233 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 229 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4105  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 229 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1626  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 236 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  44.07 
 
 		 403 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 235 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 231 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 270 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 231 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.6 
 
 		 326 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1472  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  38.6 
 
 		 326 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 231 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 229 aa  83.6  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  38.68 
 
 		 170 aa  83.6  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  36.52 
 
 		 229 aa  83.6  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  38.14 
 
 		 242 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  37.29 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1003  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.4 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3123  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.07 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1555  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0171  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1805  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 		 367 aa  82  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.5 
 
 		 354 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1744  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 229 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 223 aa  80.9  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  34.19 
 
 		 356 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_137  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 235 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0747  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  38.14 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.4 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  38.14 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2032  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.59 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.81 
 
 		 933 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 437 aa  78.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0734  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0398  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0315  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.198988 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  35.85 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  42.74 
 
 		 391 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 687 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0333  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  35.9 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.75 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0241  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>