More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3404 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  41.77 
 
 		 1155 aa  648    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  45.57 
 
 		 1155 aa  681    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  44.46 
 
 		 1132 aa  681    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  45.27 
 
 		 1181 aa  666    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  47.44 
 
 		 1127 aa  731    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06991  DNA polymerase III subunit alpha  66.92 
 
 		 1171 aa  1098    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.232183 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  44.47 
 
 		 1165 aa  659    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  42.08 
 
 		 1156 aa  650    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4135  DNA polymerase III subunit alpha  74.49 
 
 		 877 aa  1376    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.14344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  42.64 
 
 		 1122 aa  641    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  45.38 
 
 		 1173 aa  671    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2428  DNA polymerase III subunit alpha  84.34 
 
 		 874 aa  1534    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0265  DNA polymerase III subunit alpha  67.3 
 
 		 1172 aa  1114    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15831  DNA polymerase III subunit alpha  68.18 
 
 		 1171 aa  1124    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1603  DNA polymerase III subunit alpha  76.75 
 
 		 877 aa  1419    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09131  DNA polymerase III subunit alpha  64.65 
 
 		 1165 aa  1072    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4334  DNA polymerase III subunit alpha  74.34 
 
 		 1162 aa  1219    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  43.65 
 
 		 1156 aa  653    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  43.55 
 
 		 1179 aa  666    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1301  DNA polymerase III subunit alpha  67.55 
 
 		 1172 aa  1120    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.357557  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1158  DNA polymerase III subunit alpha  68.56 
 
 		 1172 aa  1130    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.304661  normal  0.960715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  43.48 
 
 		 1155 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  44.29 
 
 		 1165 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3682  DNA polymerase III subunit alpha  84.34 
 
 		 874 aa  1534    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.362078 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0854  DNA polymerase III subunit alpha  64.27 
 
 		 1165 aa  1073    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2199  DNA polymerase III subunit alpha  70.37 
 
 		 870 aa  1300    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.16253 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1233  DNA polymerase III, alpha subunit  42.73 
 
 		 1160 aa  646    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  45.92 
 
 		 1156 aa  715    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0592  DNA polymerase III subunit alpha  46.18 
 
 		 1161 aa  635    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0096  DNA polymerase III, alpha subunit  43.74 
 
 		 1151 aa  656    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  42.04 
 
 		 1186 aa  661    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09341  DNA polymerase III subunit alpha  67.05 
 
 		 1172 aa  1114    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.146562 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  46.62 
 
 		 1134 aa  706    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  45.52 
 
 		 1145 aa  699    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09151  DNA polymerase III subunit alpha  64.27 
 
 		 1165 aa  1068    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  43.4 
 
 		 1159 aa  669    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  46.42 
 
 		 1145 aa  692    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  44.04 
 
 		 1165 aa  642    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1262  DNA polymerase III DnaE  44.57 
 
 		 1139 aa  653    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.842621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  46.34 
 
 		 1225 aa  709    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  43.49 
 
 		 1157 aa  665    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1889  DNA polymerase III, alpha subunit / intein  76.7 
 
 		 2684 aa  1168    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1459  DNA polymerase III DnaE  43.22 
 
 		 1159 aa  635    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150549  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10281  DNA polymerase III subunit alpha  64.65 
 
 		 1165 aa  1062    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  43.9 
 
 		 1130 aa  695    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  46.68 
 
 		 1075 aa  716    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  43.18 
 
 		 1164 aa  649    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  47.89 
 
 		 1139 aa  718    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  43.25 
 
 		 1184 aa  669    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  45.7 
 
 		 1607 aa  639    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3404  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 		 876 aa  1801    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.605103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  44.01 
 
 		 1174 aa  691    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  45.33 
 
 		 1175 aa  658    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  43.61 
 
 		 1190 aa  635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1396  DNA polymerase III, alpha subunit  42.28 
 
 		 1159 aa  635  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253021  normal  0.727837 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  43.84 
 
 		 1182 aa  633  1e-180  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.836983  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0212  DNA polymerase III, alpha subunit  42.52 
 
 		 1167 aa  629  1e-179  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000022067  normal  0.693797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1885  DNA polymerase III, alpha subunit  42.75 
 
 		 1182 aa  627  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  42.64 
 
 		 1148 aa  626  1e-178  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  42.86 
 
 		 1170 aa  624  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  42.23 
 
 		 1170 aa  623  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1054  DNA polymerase III subunit alpha  42.4 
 
 		 1190 aa  622  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.785794  normal  0.120623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3525  DNA polymerase III, alpha subunit  41.09 
 
 		 1210 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  41.21 
 
 		 1217 aa  616  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0506  DNA polymerase III subunit alpha  42.96 
 
 		 1201 aa  617  1e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  43.54 
 
 		 1149 aa  614  9.999999999999999e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  41.09 
 
 		 1210 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  41.52 
 
 		 1240 aa  615  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  41.77 
 
 		 1170 aa  613  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3593  DNA polymerase III, alpha subunit  40.97 
 
 		 1210 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  41.7 
 
 		 1195 aa  614  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1288  DNA polymerase III subunit alpha  43.14 
 
 		 1200 aa  609  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0741  DNA polymerase III subunit alpha  43.01 
 
 		 1200 aa  609  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.607066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3172  DNA polymerase III subunit alpha  39.9 
 
 		 1175 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.450877  hitchhiker  0.0000979148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  40.46 
 
 		 1182 aa  612  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1638  DNA polymerase III, alpha subunit  41.56 
 
 		 1189 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2092  DNA polymerase III, alpha subunit  40.09 
 
 		 1271 aa  607  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.346877  normal  0.0514777 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0818  DNA polymerase III subunit alpha  43.01 
 
 		 1200 aa  608  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1425  DNA polymerase III subunit alpha  43.43 
 
 		 1174 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.59393 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0910  DNA polymerase III subunit alpha  42.4 
 
 		 1186 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.689093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1074  DNA polymerase III, alpha subunit  41.85 
 
 		 1180 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0485  DNA polymerase III subunit alpha  42.59 
 
 		 1203 aa  608  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3187  DNA polymerase III subunit alpha  40.85 
 
 		 1180 aa  604  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.527295 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  43.33 
 
 		 1148 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1798  DNA polymerase III subunit alpha  43.31 
 
 		 1177 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  40.2 
 
 		 1162 aa  605  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3245  DNA polymerase III, alpha subunit  42.34 
 
 		 1185 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0091  DNA polymerase III, alpha subunit  42.17 
 
 		 1279 aa  601  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00483462  normal  0.136645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0842  DNA polymerase III, alpha subunit  40.95 
 
 		 1262 aa  601  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.888931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2126  DNA polymerase III subunit alpha  41.16 
 
 		 1257 aa  599  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.794686  normal  0.520943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1784  DNA polymerase III subunit alpha  42.94 
 
 		 1177 aa  601  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  41.71 
 
 		 1177 aa  601  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  41.64 
 
 		 1272 aa  598  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3857  DNA polymerase III, alpha subunit  41.8 
 
 		 1296 aa  598  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  40.39 
 
 		 1165 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  41.07 
 
 		 1166 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2892  DNA polymerase III alpha subunit  42.42 
 
 		 1173 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0503022  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  41.01 
 
 		 1201 aa  593  1e-168  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00506055  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16450  DNA polymerase III subunit alpha  39.8 
 
 		 1183 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0617237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0094  DNA polymerase III, alpha subunit  40.24 
 
 		 1194 aa  595  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.866734  decreased coverage  0.0038584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>