148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_69740 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  100 
 
 		 389 aa  736    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  86.38 
 
 		 389 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  53.83 
 
 		 389 aa  360  3e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  53.7 
 
 		 272 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1089  major facilitator transporter  42.9 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1055  putative MFS transporter  60.55 
 
 		 116 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  28.49 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  30.52 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.96 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  27.65 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.54 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  27.9 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  29.07 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 387 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  29.61 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  44.26 
 
 		 477 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2543  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 		 474 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  41.18 
 
 		 499 aa  50.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 428 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  26.09 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.55 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 489 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.25 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  33.91 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1888  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.65 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1089  multidrug resistance transporter, Bcr family  25.69 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  40.98 
 
 		 492 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  37.7 
 
 		 480 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.33 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.39 
 
 		 433 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.51 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1712  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.63 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17300  Major facilitator superfamily transporter  32.56 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  31.31 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.48 
 
 		 530 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  35.05 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.81 
 
 		 587 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.7 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.46 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.08 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  35.48 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 420 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.82 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.06 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4261  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.861934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.96 
 
 		 454 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.44 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  34.69 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.21 
 
 		 509 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  27.54 
 
 		 530 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>