92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  100 
 
 
294 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  59.72 
 
 
292 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  55.36 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  51.09 
 
 
286 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  38.93 
 
 
305 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  37.77 
 
 
291 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  38.26 
 
 
291 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  38.43 
 
 
305 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  38.77 
 
 
295 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  38.77 
 
 
295 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  37.5 
 
 
305 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  36.43 
 
 
305 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  36.79 
 
 
305 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  36.79 
 
 
305 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  38.13 
 
 
301 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  36.77 
 
 
312 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  35.11 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  35.14 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  34.04 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  34.78 
 
 
462 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  35.37 
 
 
293 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  35.37 
 
 
293 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  35.37 
 
 
293 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  35.37 
 
 
293 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  35.37 
 
 
293 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  34.56 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  28.27 
 
 
287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  30.07 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  35.14 
 
 
293 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  34.23 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  28.37 
 
 
288 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
300 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  37.76 
 
 
290 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  37.76 
 
 
290 aa  123  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
302 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  30.95 
 
 
328 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  31.58 
 
 
296 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  34.44 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  34.17 
 
 
298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  33.22 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  31.58 
 
 
289 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  30.74 
 
 
291 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  33.69 
 
 
300 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  34.47 
 
 
291 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  31.07 
 
 
303 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  31.62 
 
 
473 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  31.74 
 
 
336 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  32.35 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  31.74 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  31.4 
 
 
336 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  31.4 
 
 
336 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  31.4 
 
 
336 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  31.4 
 
 
336 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  29.91 
 
 
285 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  33.68 
 
 
298 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  27.91 
 
 
321 aa  112  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  33.33 
 
 
330 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
348 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  29.54 
 
 
279 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  30.98 
 
 
300 aa  95.9  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  30.95 
 
 
346 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  30.95 
 
 
346 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  30.95 
 
 
346 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  31.62 
 
 
346 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  31.91 
 
 
306 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  31.19 
 
 
357 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  31.97 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  31.58 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  29.28 
 
 
278 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
288 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  27.02 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
317 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1033  hypothetical protein  28.4 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  23.16 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  26.69 
 
 
336 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
360 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0371  hypothetical protein  24.83 
 
 
615 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
274 aa  45.8  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  42.16 
 
 
294 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0979  alpha/beta hydrolase fold  30.06 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0862357 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  23.86 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  23.86 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.57 
 
 
364 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  31.71 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  24.38 
 
 
286 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  35.24 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  24.38 
 
 
286 aa  42.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  35.24 
 
 
303 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>