139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40290 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_40290  LasA protease precursor  100 
 
 		 418 aa  851    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0437567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3417  LasA protease precursor  86.36 
 
 		 418 aa  712    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.38875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2622  peptidase M23B  55.09 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4241  peptidase M23B  51.05 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1834  LasA protease precursor  32.7 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.341416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0869  LasA protease precursor  32.7 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0779  LasA protease precursor  32.7 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.113695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2144  hypothetical protein  32.7 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00533951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2358  Peptidase M23  32.61 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0055  Peptidase M23  34.75 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.738429  decreased coverage  0.00000593211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2357  Peptidase M23  27.94 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  35.45 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  24.12 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  32.8 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3100  Peptidase M23  28.07 
 
 		 954 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  26.69 
 
 		 630 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5290  peptidase M23B  32.65 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  31.36 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  30.23 
 
 		 387 aa  53.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  30.4 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  28 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  37.04 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  39.73 
 
 		 524 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  41.27 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  38.81 
 
 		 307 aa  51.2  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  36.9 
 
 		 669 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.96 
 
 		 326 aa  50.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  38.81 
 
 		 448 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2287  peptidase M23B  33.33 
 
 		 331 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  33.71 
 
 		 269 aa  49.7  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  38.46 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  33.06 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  36.78 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  34.71 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3056  hypothetical protein  28.34 
 
 		 579 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000386731  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3026  Peptidase M23  31.14 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  36.36 
 
 		 321 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  32.26 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  36.36 
 
 		 319 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  37.31 
 
 		 277 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  31.03 
 
 		 527 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  35.87 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  26.67 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  38.2 
 
 		 539 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  33.33 
 
 		 288 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  37.68 
 
 		 453 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1247  M23/37 family peptidase  36.08 
 
 		 297 aa  47  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  35.82 
 
 		 649 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  25.57 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  25.95 
 
 		 452 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.8 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  32.61 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  34.33 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  35.29 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  29.55 
 
 		 1048 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  37.5 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  32.61 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  34.33 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  34.92 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  29.77 
 
 		 615 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  35.82 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  37.68 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  34.92 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  29.82 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  38.1 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  31.06 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  41.27 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2489  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  33.85 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  32.05 
 
 		 506 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  31.03 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  37.31 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  34.33 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  25.56 
 
 		 293 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  30.43 
 
 		 137 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.82 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  38.1 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  32.53 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  34.85 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  32.84 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  32.53 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  32.61 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  32.53 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  33.33 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  34.07 
 
 		 280 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  35 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  37.68 
 
 		 287 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  39.68 
 
 		 727 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  29.22 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  39.68 
 
 		 727 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  32.61 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  28.57 
 
 		 273 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  32.98 
 
 		 312 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  30.05 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  31.25 
 
 		 648 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  30 
 
 		 244 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  34.41 
 
 		 276 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  26.61 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  30.19 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  38.1 
 
 		 238 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>