More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3026 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3026  Peptidase M23  100 
 
 
433 aa  861    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  40 
 
 
304 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  36.72 
 
 
294 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  37.64 
 
 
491 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  38.76 
 
 
506 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  40.24 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  38.06 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6024  Peptidase M23  38.85 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  40 
 
 
468 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  36.7 
 
 
445 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  45.12 
 
 
491 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  46.99 
 
 
313 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  35.37 
 
 
319 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  41.84 
 
 
414 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  40.66 
 
 
300 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  40.91 
 
 
229 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1258  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.18 
 
 
359 aa  60.1  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.14 
 
 
454 aa  60.1  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  40.96 
 
 
323 aa  60.1  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  33.8 
 
 
491 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  40.51 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  40.51 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  40.51 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  40.51 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  43.04 
 
 
376 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  35 
 
 
271 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  46.43 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  44.58 
 
 
238 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  29.8 
 
 
286 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  41.67 
 
 
253 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  49.18 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  42.17 
 
 
309 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  41.03 
 
 
404 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  47.27 
 
 
288 aa  58.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  52 
 
 
439 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  52 
 
 
330 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  33.87 
 
 
418 aa  57.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  37.11 
 
 
286 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  37.21 
 
 
305 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  41.03 
 
 
247 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  35.71 
 
 
346 aa  57.4  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  35.2 
 
 
414 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  46.84 
 
 
455 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  37.93 
 
 
286 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  39.24 
 
 
431 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  39.24 
 
 
431 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  39.24 
 
 
431 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  39.24 
 
 
434 aa  57  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  39.24 
 
 
431 aa  57.4  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  40.2 
 
 
305 aa  57  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  40.24 
 
 
233 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  34.96 
 
 
442 aa  57  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  41.77 
 
 
301 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  44.58 
 
 
305 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  38 
 
 
321 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  43.21 
 
 
295 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  33.58 
 
 
282 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  41.89 
 
 
428 aa  56.6  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  30.41 
 
 
337 aa  56.6  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  44.44 
 
 
438 aa  56.6  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  43.18 
 
 
450 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  39.73 
 
 
269 aa  56.6  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  41.25 
 
 
294 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  39.24 
 
 
423 aa  56.6  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  48.39 
 
 
430 aa  56.6  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  39.51 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  41.25 
 
 
292 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  52 
 
 
430 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  43.75 
 
 
293 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  43.9 
 
 
415 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  36.36 
 
 
316 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  36.9 
 
 
465 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  36.27 
 
 
446 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  40.96 
 
 
305 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  41.25 
 
 
291 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  38.55 
 
 
276 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  46 
 
 
443 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  42.86 
 
 
303 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  43.9 
 
 
459 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  44.16 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  27.82 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  38.3 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  33.86 
 
 
645 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  40.96 
 
 
541 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  43.18 
 
 
345 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0558  peptidase M23B  40.21 
 
 
445 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.926866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  41.82 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.46 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  32.43 
 
 
271 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4194  peptidase M23B  32.12 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  41.25 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  43.18 
 
 
457 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  45.9 
 
 
457 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  35.45 
 
 
301 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0052  peptidase M23B  32.12 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.672744  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  43.18 
 
 
457 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  43.9 
 
 
456 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  39.81 
 
 
446 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  30.5 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  43.18 
 
 
457 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>