45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0055 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0055  Peptidase M23  100 
 
 		 355 aa  706    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.738429  decreased coverage  0.00000593211 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2144  hypothetical protein  38.74 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00533951  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0779  LasA protease precursor  38.74 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.113695  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0869  LasA protease precursor  38.74 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2357  Peptidase M23  37.46 
 
 		 402 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1834  LasA protease precursor  38.03 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.341416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2358  Peptidase M23  34.65 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 579 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000386731  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5290  peptidase M23B  30.27 
 
 		 554 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3100  Peptidase M23  33.33 
 
 		 954 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3417  LasA protease precursor  32.6 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.38875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2622  peptidase M23B  25.95 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40290  LasA protease precursor  34.04 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0437567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4241  peptidase M23B  32.43 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  33.66 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  24.28 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  34.09 
 
 		 690 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  35.23 
 
 		 681 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  36.23 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  30.77 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  34.09 
 
 		 680 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  23.87 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  34.09 
 
 		 676 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  44.44 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  36.59 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  37.5 
 
 		 224 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  32.26 
 
 		 582 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  30 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  33.33 
 
 		 692 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  23.46 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  34.17 
 
 		 445 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  32.95 
 
 		 695 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  23.46 
 
 		 466 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  28.57 
 
 		 550 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  44.23 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  34.38 
 
 		 524 aa  43.5  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  25.11 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.1 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  34.74 
 
 		 482 aa  42.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  33.02 
 
 		 352 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  30.77 
 
 		 475 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  28.21 
 
 		 317 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  33.98 
 
 		 475 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  39.44 
 
 		 321 aa  42.7  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  33.01 
 
 		 446 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>