More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2287 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2287  peptidase M23B  100 
 
 		 331 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2489  XRE family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1204  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0665885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2144  peptidase M23B  58.99 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0438532  normal  0.0198531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3030  peptidase M23B  51.7 
 
 		 204 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3687  peptidase M23B  47.48 
 
 		 213 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00124849  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1572  Peptidase M23  47.92 
 
 		 214 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  45.26 
 
 		 527 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  33.58 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  44.94 
 
 		 524 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  37.5 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  38.28 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  40.18 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  42.86 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  46.15 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  33.58 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  44.68 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  31.97 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  43.62 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  45.45 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  43.69 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  45.45 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  38.39 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  39.13 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  33.78 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  42.34 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  42.22 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  42.7 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  42.7 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  29.23 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  43.82 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  53.33 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  47.19 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  43.33 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  40.91 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40.43 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  44.83 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  41.24 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  43.33 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  37.23 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.56 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  37.24 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  48.68 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  44.94 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.59 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  38.97 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  38.95 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  37.12 
 
 		 465 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  46.67 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.63 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  43.18 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  37.41 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  37.68 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  38.89 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  36.29 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  43.01 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  45.98 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  40.96 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  28.35 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  43.37 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  38.64 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  40.83 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  46.67 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  34.05 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  36.73 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  34.51 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  39.08 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  38.2 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  36.56 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  41.46 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  32.35 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  37 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.04 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  33.33 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  41.3 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  41.49 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  44.32 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  43.37 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  34.11 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  33.8 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  44 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  41.86 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  44.32 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  37 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  37 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  37 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  37.93 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  37 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  41.67 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  41.76 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  33.62 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  45.45 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  34.48 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  43.21 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  41.94 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  37.93 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  37 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  36.64 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  39.22 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>