More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2144 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2144  peptidase M23B  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0438532  normal  0.0198531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3030  peptidase M23B  77.34 
 
 		 204 aa  288  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1572  Peptidase M23  48.6 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2489  XRE family transcriptional regulator  60.43 
 
 		 353 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3687  peptidase M23B  46.43 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00124849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2287  peptidase M23B  58.99 
 
 		 331 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1204  transcriptional regulator, XRE family  48.53 
 
 		 323 aa  131  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0665885 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.94 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  51.72 
 
 		 325 aa  82  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  37.58 
 
 		 569 aa  81.6  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  34.16 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  38.41 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  37.86 
 
 		 317 aa  79  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  45.19 
 
 		 490 aa  78.6  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1544  peptidase M23B  33.33 
 
 		 336 aa  78.2  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  38.41 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  46.74 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  43.33 
 
 		 524 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  49.46 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  39.29 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  41.84 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  37.1 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  41.84 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  41.84 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  43.62 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  41.84 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  34.29 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  35.07 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  37.12 
 
 		 513 aa  72.8  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  43.02 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  35.71 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  44.68 
 
 		 434 aa  72.4  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  48.45 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  40 
 
 		 503 aa  72.4  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  32.7 
 
 		 313 aa  72  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  44.86 
 
 		 582 aa  71.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  41.49 
 
 		 475 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  47.67 
 
 		 439 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  40.43 
 
 		 687 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  42.59 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  34.85 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  36.43 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  42.11 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  43.75 
 
 		 690 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  44.21 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  44.74 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  43.96 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  42.55 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  38 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  41.41 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  40.59 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  31.65 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  42.55 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  40 
 
 		 680 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  51.52 
 
 		 446 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  43.02 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  37.36 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  43.02 
 
 		 431 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  43.02 
 
 		 431 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  41.49 
 
 		 503 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  43 
 
 		 439 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  43 
 
 		 439 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  43 
 
 		 439 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  43 
 
 		 439 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  43 
 
 		 439 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  42.68 
 
 		 498 aa  68.6  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  41.18 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  40.37 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  39 
 
 		 681 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  41.84 
 
 		 428 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  41.84 
 
 		 470 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  43 
 
 		 419 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  43 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  43 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  41.86 
 
 		 434 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  41.49 
 
 		 474 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  42.55 
 
 		 433 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  43 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  42.55 
 
 		 433 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  43 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  42.55 
 
 		 433 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  43 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  43 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  43 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  43 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  42.55 
 
 		 433 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  41 
 
 		 440 aa  68.2  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  50.7 
 
 		 459 aa  68.2  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  43.96 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  40.43 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  40.22 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  40.66 
 
 		 692 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  35.21 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  35.21 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  36.08 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  35.21 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  39 
 
 		 695 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  40.22 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  36.05 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  41.05 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>