More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3390 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  100 
 
 
342 aa  690    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  71.64 
 
 
306 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  62.86 
 
 
294 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  100 
 
 
480 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  48.18 
 
 
304 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  79.65 
 
 
477 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6031  hypothetical protein  41.83 
 
 
269 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415177  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  48.6 
 
 
599 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  43.21 
 
 
506 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6024  Peptidase M23  42.47 
 
 
194 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3026  Peptidase M23  40.13 
 
 
433 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8081  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.65 
 
 
769 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.887421  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8080  Serine/threonine protein kinase-like protein  51.65 
 
 
726 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4392  hypothetical protein  43.86 
 
 
201 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  42.86 
 
 
491 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  48.96 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  49.46 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  48.28 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  47.31 
 
 
376 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  37.41 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  45.83 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  43.62 
 
 
288 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2410  hypothetical protein  42.57 
 
 
137 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114407 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5539  hypothetical protein  43.64 
 
 
133 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2409  hypothetical protein  41.75 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  43.09 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  35.59 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  41.67 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  45.54 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  33.56 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  36.57 
 
 
491 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  45.65 
 
 
445 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  51.14 
 
 
603 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  50.59 
 
 
564 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  50.59 
 
 
564 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  44.57 
 
 
633 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  51.14 
 
 
603 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  50.59 
 
 
564 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  50.59 
 
 
564 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  43.16 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  39.13 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  42.57 
 
 
430 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  34.48 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  44.23 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  43.62 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  44.68 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  35.37 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  40.86 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  46.74 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  33.77 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  36.55 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  47.44 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  45.78 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  44.21 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  50.59 
 
 
564 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  42.55 
 
 
450 aa  69.3  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  36.09 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  44.9 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  41.18 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  42.27 
 
 
325 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  43.01 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2411  hypothetical protein  42.05 
 
 
138 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0662721 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  43.62 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17750  peptidase M23B  41.49 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  35.46 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  46.67 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  37.5 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  42.39 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  46.34 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  40.37 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  43.01 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  47.56 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  42.55 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0287  Peptidase M23  37.7 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  35.46 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  45.26 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5297  hypothetical protein  46.24 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  41.44 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  45.24 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  38.61 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  45.26 
 
 
457 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  41.94 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  42.71 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  45.16 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  32.57 
 
 
590 aa  67  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  46.6 
 
 
538 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  32.73 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  43.56 
 
 
430 aa  66.6  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  39.13 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  45.45 
 
 
459 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  47.06 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  45.74 
 
 
468 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  44.58 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.6 
 
 
442 aa  66.2  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  45.12 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  44.71 
 
 
605 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  38.89 
 
 
299 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  42.11 
 
 
455 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  46.34 
 
 
379 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  47.06 
 
 
424 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>