More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6024 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6024  Peptidase M23  100 
 
 
194 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  50.34 
 
 
304 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  42.14 
 
 
294 aa  95.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3026  Peptidase M23  40.14 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  42.07 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  43.24 
 
 
506 aa  82  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  42.47 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  39.13 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  48.15 
 
 
468 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  45.24 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  38.05 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0085  Peptidase M23  45.98 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  41.67 
 
 
464 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  41.18 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  45.26 
 
 
453 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  36.84 
 
 
824 aa  65.1  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  41.35 
 
 
450 aa  64.7  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  45.68 
 
 
314 aa  64.7  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  39.6 
 
 
297 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  40.66 
 
 
376 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  44.05 
 
 
464 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  38.1 
 
 
404 aa  63.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  35.59 
 
 
465 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  39.45 
 
 
445 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  41.35 
 
 
455 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  44.74 
 
 
457 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  36.73 
 
 
249 aa  62  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  33.53 
 
 
482 aa  62  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  37.74 
 
 
446 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  42.53 
 
 
438 aa  61.6  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  42.11 
 
 
491 aa  62  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  42.71 
 
 
478 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  37.37 
 
 
602 aa  61.6  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  35.29 
 
 
751 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  42.17 
 
 
430 aa  61.6  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  44.58 
 
 
633 aa  61.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  44.05 
 
 
491 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  37.38 
 
 
447 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  37.38 
 
 
447 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  41.67 
 
 
474 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  42.35 
 
 
541 aa  61.2  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  44.58 
 
 
281 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  44.58 
 
 
281 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  37.63 
 
 
727 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  39.42 
 
 
457 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  40.79 
 
 
446 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  37.63 
 
 
727 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.27 
 
 
343 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  37.5 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  36.46 
 
 
379 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  40.21 
 
 
300 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  40.38 
 
 
455 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  40.45 
 
 
412 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  39.51 
 
 
431 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  40.22 
 
 
247 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  42.53 
 
 
354 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  38.78 
 
 
271 aa  59.3  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  35.38 
 
 
491 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  31.33 
 
 
754 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  39.36 
 
 
317 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  42.05 
 
 
443 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  44.19 
 
 
423 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  39.51 
 
 
441 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  37.21 
 
 
283 aa  59.3  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  38.24 
 
 
284 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  42.53 
 
 
295 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  43.48 
 
 
305 aa  59.3  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  39.58 
 
 
464 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40 
 
 
442 aa  58.9  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  39.53 
 
 
305 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  42.53 
 
 
425 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  44.05 
 
 
293 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  35.85 
 
 
590 aa  58.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  38.46 
 
 
456 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  40.66 
 
 
494 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  36.64 
 
 
231 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  40.7 
 
 
512 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  40.7 
 
 
472 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  38.46 
 
 
459 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  41.46 
 
 
372 aa  58.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  42.53 
 
 
425 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  39.05 
 
 
315 aa  58.2  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  39.78 
 
 
452 aa  58.2  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  40.96 
 
 
455 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  42.53 
 
 
475 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  40.7 
 
 
471 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  39.56 
 
 
323 aa  58.2  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  40.96 
 
 
451 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  38.95 
 
 
440 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  41.1 
 
 
464 aa  57.8  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  35.87 
 
 
417 aa  57.8  0.00000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0287  Peptidase M23  34.86 
 
 
297 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.62 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  41.46 
 
 
321 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  35.35 
 
 
373 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  38.27 
 
 
309 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  40.23 
 
 
470 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  47.22 
 
 
236 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  37 
 
 
223 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1579  Peptidase M23  42.53 
 
 
469 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>