20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2410 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2410  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  276  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.114407 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5539  hypothetical protein  55.56 
 
 
133 aa  134  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2411  hypothetical protein  51.8 
 
 
138 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0662721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2409  hypothetical protein  57.41 
 
 
139 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  48.51 
 
 
306 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.56 
 
 
477 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  42.57 
 
 
480 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  42.57 
 
 
342 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5662  hypothetical protein  37.23 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602875  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7806  hypothetical protein  33.85 
 
 
193 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  37.14 
 
 
304 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5536  spore-associated protein precursor  43.01 
 
 
164 aa  60.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333646  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.45 
 
 
599 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8080  Serine/threonine protein kinase-like protein  45 
 
 
726 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8081  Serine/threonine protein kinase-like protein  47.06 
 
 
769 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.887421  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4392  hypothetical protein  35.24 
 
 
201 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5297  hypothetical protein  34.48 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6031  hypothetical protein  32.04 
 
 
269 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415177  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  35 
 
 
294 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03218  conserved hypothetical protein  34.57 
 
 
148 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.232681  normal  0.460292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>