19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2411 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2411  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  275  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0662721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2409  hypothetical protein  60.75 
 
 		 139 aa  126  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5539  hypothetical protein  52.17 
 
 		 133 aa  114  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2410  hypothetical protein  53.77 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.114407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  47.73 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.59 
 
 		 477 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  42.05 
 
 		 480 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  42.05 
 
 		 342 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.94 
 
 		 599 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7806  hypothetical protein  32.31 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  37.5 
 
 		 304 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5662  hypothetical protein  32.37 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  37.62 
 
 		 294 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4392  hypothetical protein  35.79 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5322  hypothetical protein  34.09 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8081  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.35 
 
 		 769 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.887421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5297  hypothetical protein  30.77 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5536  spore-associated protein precursor  36.46 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8080  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.36 
 
 		 726 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>