15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5662 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5662  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  270  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5322  hypothetical protein  34.23 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7806  hypothetical protein  35.61 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  37.61 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2410  hypothetical protein  34.26 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.114407 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5539  hypothetical protein  33.83 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2409  hypothetical protein  35.65 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2411  hypothetical protein  35.65 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0662721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  31.75 
 
 		 306 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  31.9 
 
 		 342 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4392  hypothetical protein  27.13 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  31.86 
 
 		 480 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.76 
 
 		 477 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5536  spore-associated protein precursor  37.69 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5297  hypothetical protein  35.16 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>