20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5539 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5539  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  265  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2410  hypothetical protein  57.69 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.114407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2409  hypothetical protein  57.94 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2411  hypothetical protein  53.23 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0662721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  47.27 
 
 		 306 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  43.64 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  43.64 
 
 		 480 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.86 
 
 		 477 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5536  spore-associated protein precursor  46.24 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7806  hypothetical protein  37.21 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  38.46 
 
 		 304 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8081  Serine/threonine protein kinase-like protein  42 
 
 		 769 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.887421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8080  Serine/threonine protein kinase-like protein  43.9 
 
 		 726 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  40 
 
 		 599 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4392  hypothetical protein  37.36 
 
 		 201 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5662  hypothetical protein  33.83 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  44.83 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5322  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6031  hypothetical protein  31.11 
 
 		 269 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>