20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2409 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2409  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2411  hypothetical protein  59.02 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0662721 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5539  hypothetical protein  52.24 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2410  hypothetical protein  57.55 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.114407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  47.57 
 
 		 306 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  41.75 
 
 		 480 aa  74.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.75 
 
 		 477 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  41.75 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5662  hypothetical protein  36.49 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4392  hypothetical protein  37.04 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  35.71 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  40.78 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.19 
 
 		 599 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5297  hypothetical protein  33.54 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5536  spore-associated protein precursor  37.8 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7806  hypothetical protein  32.06 
 
 		 193 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5322  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8080  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.89 
 
 		 726 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8081  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.92 
 
 		 769 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.887421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6031  hypothetical protein  32.43 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>