128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_35680 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  784    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  97.47 
 
 		 395 aa  763    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  64.16 
 
 		 392 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  63.64 
 
 		 392 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  62.89 
 
 		 396 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 747 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  25.94 
 
 		 797 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 763 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 774 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  21.04 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 789 aa  73.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 		 790 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  24.5 
 
 		 761 aa  73.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 780 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 765 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  24.69 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  23.3 
 
 		 759 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  29.89 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 823 aa  63.2  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 		 767 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 774 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  28.94 
 
 		 443 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0566  glycosyl transferase, group 1  21.48 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  22.3 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  20.72 
 
 		 756 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 394 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  24.44 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  37 
 
 		 417 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 409 aa  49.7  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 762 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 393 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4956  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  21.93 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 366 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  23.11 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  22.27 
 
 		 348 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  27.57 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0058  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 366 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 364 aa  46.6  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  26.07 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  25.09 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  26.5 
 
 		 1635 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  30.77 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 639 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1322  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124094  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  27.05 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6087  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0801874  hitchhiker  0.00307291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>