More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3926 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  100 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  40.49 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  48.08 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  44.26 
 
 		 161 aa  101  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  48.08 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.8 
 
 		 773 aa  98.6  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  37.16 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 197 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  48.18 
 
 		 142 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  33.14 
 
 		 202 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  45.54 
 
 		 587 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  32.62 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  40 
 
 		 577 aa  90.9  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  37.91 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.25 
 
 		 516 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.17 
 
 		 762 aa  89.4  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  41.8 
 
 		 1068 aa  89  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  40.2 
 
 		 520 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  40.2 
 
 		 520 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  33.77 
 
 		 479 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  40.2 
 
 		 516 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  39.22 
 
 		 520 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  39.22 
 
 		 520 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  39.22 
 
 		 520 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  39.22 
 
 		 520 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.71 
 
 		 601 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.61 
 
 		 852 aa  85.5  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.21 
 
 		 759 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  30.41 
 
 		 510 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  31.45 
 
 		 499 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  31.45 
 
 		 499 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.52 
 
 		 1055 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  40.8 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 136 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.61 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  37.04 
 
 		 548 aa  76.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  40.87 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.67 
 
 		 440 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  36 
 
 		 481 aa  75.9  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  38.52 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  29.86 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  36.63 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1876  hypothetical protein  33.33 
 
 		 775 aa  72.8  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  37.96 
 
 		 432 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  38.74 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  33.05 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  35.51 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.62 
 
 		 429 aa  68.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.97 
 
 		 395 aa  68.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  34.35 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.51 
 
 		 749 aa  68.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 463 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.39 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  34.26 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  34.95 
 
 		 139 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  34.78 
 
 		 388 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.91 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.64 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.94 
 
 		 432 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  32.71 
 
 		 669 aa  65.9  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  34.51 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.03 
 
 		 448 aa  65.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  38.94 
 
 		 432 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  34.11 
 
 		 430 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  34.11 
 
 		 430 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  36.97 
 
 		 437 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  34.11 
 
 		 430 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  32.56 
 
 		 469 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1787  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  32.79 
 
 		 335 aa  65.1  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.9 
 
 		 448 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.3 
 
 		 699 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  35.96 
 
 		 430 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  32.67 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  36.45 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  33.04 
 
 		 712 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  38.74 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.04 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.74 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  32.71 
 
 		 675 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.28 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  33.64 
 
 		 675 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.51 
 
 		 531 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.81 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.08 
 
 		 689 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  30.19 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.11 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 407 aa  62.4  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  31.3 
 
 		 391 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  30.36 
 
 		 728 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  34.81 
 
 		 419 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.93 
 
 		 531 aa  62  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  34.69 
 
 		 439 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  33.02 
 
 		 439 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  34.19 
 
 		 152 aa  62  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  36.94 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  33.64 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>