More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31592 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  100 
 
 		 325 aa  659    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51811  hydroxymethylbilane synthase  59.25 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  57.78 
 
 		 321 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  53.25 
 
 		 311 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2529  porphobilinogen deaminase  53.7 
 
 		 318 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0679  porphobilinogen deaminase  53.92 
 
 		 314 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  51.62 
 
 		 318 aa  295  9e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0551  porphobilinogen deaminase  53.92 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2334  porphobilinogen deaminase  53.92 
 
 		 322 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69155  normal  0.249742 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3630  porphobilinogen deaminase  53.77 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1349  porphobilinogen deaminase  52.81 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0471  porphobilinogen deaminase  53.43 
 
 		 316 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.834743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0562  porphobilinogen deaminase  53.79 
 
 		 316 aa  281  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  49.04 
 
 		 347 aa  278  8e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  50.49 
 
 		 309 aa  276  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 309 aa  275  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3845  porphobilinogen deaminase  49.84 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  50.16 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  46.71 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  48.06 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  47.81 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  49.82 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  46.95 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  46.95 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  46.18 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  46.02 
 
 		 320 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  46.02 
 
 		 318 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  46.02 
 
 		 320 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  46.02 
 
 		 320 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  46.02 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  45.51 
 
 		 317 aa  252  6e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  46.02 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  47.77 
 
 		 314 aa  251  8.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  46.24 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  45.67 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  46.71 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  46.24 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  45.98 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  46.76 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  48.33 
 
 		 306 aa  249  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  43.45 
 
 		 310 aa  248  7e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  47.52 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1158  porphobilinogen deaminase  48.36 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  43.92 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  46.58 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  46.5 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  47.14 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  45.8 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  46.57 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  47.48 
 
 		 313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 318 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  44.37 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  45.52 
 
 		 309 aa  242  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  44.88 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4145  porphobilinogen deaminase  48.36 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  47.12 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  47.12 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  44.88 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  45.08 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  46.45 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  45.8 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  45.85 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  45.34 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  45.88 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  43.17 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  42.33 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  44.25 
 
 		 320 aa  239  5.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  46.76 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  42.02 
 
 		 320 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  43.96 
 
 		 310 aa  238  9e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  46.41 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  43.31 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05521  porphobilinogen deaminase  41.85 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.276961 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  46.27 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  44.21 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4020  porphobilinogen deaminase  46.71 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1828  porphobilinogen deaminase  41.21 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  44.06 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  43.95 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  44.09 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  45.02 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0128  porphobilinogen deaminase  46.18 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  41.8 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  44.56 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  45.45 
 
 		 309 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  46.43 
 
 		 309 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  45.9 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  47.97 
 
 		 312 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  45.76 
 
 		 312 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  41.72 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  44.4 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  45.68 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  44.56 
 
 		 326 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  39.44 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  43.93 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  43.88 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  44.96 
 
 		 306 aa  228  9e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>