More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0492 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0492  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.628855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  45.15 
 
 		 269 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2211  alpha/beta hydrolase fold  40.22 
 
 		 270 aa  208  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  37.45 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1208  Alpha/beta hydrolase  40 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0768  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3484  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  27.05 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061882  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.81 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 274 aa  86.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0478294 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  23.68 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.71 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.91 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.6 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.71 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  37.9 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.71 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  40 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.2 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.64 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.01 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.63 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  37.84 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  24.56 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.24 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  24.23 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  37.89 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.27 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  35.85 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.94 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  25.33 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  26.12 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  25.67 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>