107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1162 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  100 
 
 		 281 aa  568  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  52.85 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  45.67 
 
 		 282 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  48.79 
 
 		 280 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  47.95 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0342  hypothetical protein  48.16 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  46.07 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  46.06 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5938  lipase class 2  44.96 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215528  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4818  lipase class 2  42.6 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  39.02 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  39.76 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  40.59 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  39.84 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2701  lipase, class 2  36.4 
 
 		 573 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4601  hypothetical protein  33.97 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  31.72 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1553  lipase class 2  39.06 
 
 		 307 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129405  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.4 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  39.33 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  37.29 
 
 		 225 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  37.3 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08500  conserved hypothetical protein  32.52 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.992333  normal  0.426408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  36.2 
 
 		 269 aa  99.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  34.08 
 
 		 222 aa  95.9  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  33.33 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1154  hypothetical protein  33.52 
 
 		 257 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  34.1 
 
 		 222 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  34.46 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  33.69 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  28.65 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  31.58 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  28.09 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  29.73 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  30.63 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  25.41 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  31.75 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  25.58 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  24.73 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  25.58 
 
 		 195 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  28.4 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  29.44 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  37.65 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0639  lipase  36.67 
 
 		 364 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.267456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5451  lipase class 2  30.1 
 
 		 338 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0820  lipase precursor  37.21 
 
 		 364 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1807  lipase precursor  37.21 
 
 		 341 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2505  lipase  37.21 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2366  lipase  37.21 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  31.22 
 
 		 450 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0661  hypothetical protein  32.69 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  31.54 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  30.83 
 
 		 2169 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  36.19 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  36.52 
 
 		 364 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  35.64 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  35.64 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  36.63 
 
 		 364 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  25.25 
 
 		 334 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3358  triacylglycerol lipase  35.4 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  36.52 
 
 		 364 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  35.64 
 
 		 364 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  32.09 
 
 		 320 aa  48.9  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2339  lipase  33.33 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  34.83 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  33.33 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1467  lipase  33.33 
 
 		 367 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  33.33 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  33.33 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3253  lipase precursor  33.33 
 
 		 367 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3138  lipase precursor  33.33 
 
 		 367 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  33.33 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  25.91 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  35 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  25.35 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  24.63 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003806  lipase precursor  34.62 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  33.91 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4189  triacylglycerol lipase  35.96 
 
 		 318 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 365 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  29.55 
 
 		 382 aa  45.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  22.9 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02696  hypothetical protein  29.3 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  34 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  33.33 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1567  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  25.83 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  27.72 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>