110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1144 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  100 
 
 		 163 aa  319  9.000000000000001e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  59.76 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  53.05 
 
 		 165 aa  160  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  50.61 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  50 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  45.34 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  46.54 
 
 		 825 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  48.17 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  47.53 
 
 		 193 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  47.17 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  45.68 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  46.62 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  41.52 
 
 		 516 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  41.98 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  41.88 
 
 		 231 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  40.35 
 
 		 520 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  42.95 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  47.13 
 
 		 179 aa  94.4  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  34.15 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  29.34 
 
 		 168 aa  90.9  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  39.02 
 
 		 166 aa  87  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  39.62 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  32.2 
 
 		 188 aa  80.5  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  30.06 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  43.33 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  32.53 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  42.55 
 
 		 478 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  39.39 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  26.99 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3667  hypothetical protein  34.34 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  43.56 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3347  hypothetical protein  30.25 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.943196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  31.82 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  30.38 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  30.38 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  29.09 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1808  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  30.72 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  38.54 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  28.48 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  26.99 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  26.99 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  29.41 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1299  hypothetical protein  32.86 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2759  hypothetical protein  34.34 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659678  normal  0.346788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  28.92 
 
 		 173 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  29.69 
 
 		 475 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  32.62 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  28.92 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  29.11 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  37.5 
 
 		 471 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  39.78 
 
 		 478 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  31.36 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  38.14 
 
 		 470 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  38.14 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  34.34 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  28.99 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  33.66 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  34.65 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  33.08 
 
 		 471 aa  54.3  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  29.65 
 
 		 589 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2887  OHCU decarboxylase  32 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0785509 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  29.69 
 
 		 475 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  35.35 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  29.69 
 
 		 475 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  32.28 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1344  OHCU decarboxylase  31.91 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0067  hypothetical protein  35.05 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3819  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0873335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  29.07 
 
 		 589 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  32.67 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  37.11 
 
 		 470 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44840  hypothetical protein  32.32 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.165597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1705  hypothetical protein  30.3 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.589299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  29.07 
 
 		 591 aa  50.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  31.48 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4287  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  29.31 
 
 		 593 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1581  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.288278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3851  hypothetical protein  31.31 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0750718  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3613  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00378889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 		 478 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 470 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  27.33 
 
 		 592 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 471 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  30.06 
 
 		 599 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  35.29 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 471 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  33.33 
 
 		 482 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  27.91 
 
 		 592 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  32.43 
 
 		 599 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  26.74 
 
 		 592 aa  44.3  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>