More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1287 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1287  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 308 aa  610  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  65.37 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0556  dihydrodipicolinate synthetase  44.56 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2117  dihydrodipicolinate synthetase  45.76 
 
 		 290 aa  219  6e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277384  normal  0.880374 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  35.07 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  36.29 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  32.21 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  33.55 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  37.77 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  39.46 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  33.96 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 371 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  30.67 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 292 aa  142  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  33.05 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  30.33 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  30.33 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  35.87 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  34.78 
 
 		 290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  35.78 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  36.04 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  34.21 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  34.21 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  35.74 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  33.78 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  33.23 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  30.33 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  36.55 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  31.68 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 290 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  34.22 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  33.19 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  34.35 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  34.35 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  30.46 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  36 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.78 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8494  dihydrodipicolinate synthase  34.29 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  30.98 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 300 aa  133  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  32.06 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  32.57 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  33.98 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  32.37 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  34.63 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2201  dihydrodipicolinate synthase  34.5 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384618  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  31.02 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  33.73 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  28.3 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  32.33 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  32.9 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  33.75 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  27.74 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  30.46 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  32.27 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.9 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  38.63 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  37.61 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  32.27 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 		 290 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>