237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4572 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  100 
 
 		 343 aa  674    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  43.23 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  45.48 
 
 		 351 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  45 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  43.67 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  42.05 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  42.91 
 
 		 336 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  40.45 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  40.69 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  40.32 
 
 		 329 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  38.28 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  39.61 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  37.89 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  37.75 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  35.21 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  37.95 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  37.9 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  38.03 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  37.5 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  36.34 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  37.24 
 
 		 340 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  36.58 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  40 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  38.67 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  35.81 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  32.92 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  37.25 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  34.67 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  35.62 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  34.55 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  38.91 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  37.03 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  41.58 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  38.08 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  33.95 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  34.58 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  38.17 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  38.61 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  38.55 
 
 		 358 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  38.61 
 
 		 328 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  37.46 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  34.21 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  30.9 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  34.87 
 
 		 312 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  34.16 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  32.48 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  31.07 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  29.18 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  38.36 
 
 		 274 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  38.28 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  37.89 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  29.27 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  39.29 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.72 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  39.81 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  30.46 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  26.32 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  38.14 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  29.63 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  36.84 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  32.43 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  33.54 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  40.82 
 
 		 565 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  36.7 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0039  parB-like partition protein  33.64 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103386  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  22.73 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  39.81 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  41.76 
 
 		 297 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0047  transcriptional repressor  33.64 
 
 		 359 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  39.76 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  22.22 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  36.84 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2844  parB-like partition protein  37.61 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  31.4 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  36.84 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  29.14 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  28.89 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  37.61 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  28.11 
 
 		 605 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  33.98 
 
 		 283 aa  51.2  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  35.04 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  40.4 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 285 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  32.89 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  39.09 
 
 		 331 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  32.37 
 
 		 294 aa  50.4  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 301 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  33.05 
 
 		 305 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  37.76 
 
 		 280 aa  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  34.38 
 
 		 289 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  35.4 
 
 		 302 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  33.04 
 
 		 422 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  35.48 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  34.68 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  33.33 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  30.46 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  30.46 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  30.46 
 
 		 330 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  38 
 
 		 317 aa  49.7  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>