More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5304 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5304  beta-lactamase  100 
 
 		 513 aa  994    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.69 
 
 		 489 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1258  beta-lactamase  36.84 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.775815  normal  0.0157714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  35.23 
 
 		 357 aa  140  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.96 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  33.04 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.19 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  30.33 
 
 		 525 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  33.98 
 
 		 381 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  30.38 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  28.47 
 
 		 476 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  28.03 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  33.18 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  29.87 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  30.77 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.22 
 
 		 508 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  30.37 
 
 		 513 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  25.7 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.69 
 
 		 601 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  27.06 
 
 		 513 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.83 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.99 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  31.68 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  27.76 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2704  beta-lactamase  28.38 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  30.4 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  28.89 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  27.21 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  23.47 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  27.27 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  27.74 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  31.16 
 
 		 778 aa  64.3  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  29.47 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.86 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  26.69 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  24.39 
 
 		 669 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  30.27 
 
 		 559 aa  62.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2137  beta-lactamase  28.85 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  23.95 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  27.65 
 
 		 5698 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.94 
 
 		 595 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  25.74 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0563  beta-lactamase  26.07 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000636485 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  27.37 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  25.94 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  24.89 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  29.89 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  29.96 
 
 		 417 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  29.89 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  29.89 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  25.31 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  24.74 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  24.87 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.64 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.66 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  26.69 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  21.22 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  28.08 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  27.45 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  25.36 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  23.21 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  27.41 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  23.21 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  25.48 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  30.25 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  25.29 
 
 		 661 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  27.27 
 
 		 385 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.92 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.19 
 
 		 526 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.57 
 
 		 578 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  27.13 
 
 		 385 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  27.1 
 
 		 635 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  28.32 
 
 		 462 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  27.27 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  27.27 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6651  beta-lactam binding protein AmpH  25.17 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  22.88 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  26.85 
 
 		 529 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  23.85 
 
 		 662 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  22.8 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  24.28 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  27.27 
 
 		 385 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30.77 
 
 		 476 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  30.49 
 
 		 674 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  26.79 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  26.79 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  26.79 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  26.79 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  26.79 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  26.79 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  22.73 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.92 
 
 		 803 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  26.79 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  26.79 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  26.79 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  26.79 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5620  beta-lactamase  33.33 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141617  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1551  beta-lactamase  24.36 
 
 		 375 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0670758  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  29.54 
 
 		 406 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>