More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4560 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 381 aa  736    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0624  putative oxidoreductase  62.64 
 
 		 369 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  53.97 
 
 		 374 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  59.62 
 
 		 360 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  57.98 
 
 		 406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0965  glucose sorbosone dehydrogenase  56.02 
 
 		 404 aa  328  9e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  54.49 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3428  glucose sorbosone dehydrogenase  53.7 
 
 		 389 aa  315  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  52.81 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3697  glucose sorbosone dehydrogenase  54.6 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  56.66 
 
 		 388 aa  308  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  48.04 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  54.63 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.24 
 
 		 809 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  50.47 
 
 		 369 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  51.65 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3368  glucose sorbosone dehydrogenase  50.15 
 
 		 353 aa  292  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  50.15 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0845  glucose sorbosone dehydrogenase  51.93 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2543  glucose sorbosone dehydrogenase  55.33 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  45.96 
 
 		 381 aa  281  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30370  glucose/sorbosone dehydrogenase  52 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.218061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2732  glucose sorbosone dehydrogenase  52 
 
 		 442 aa  280  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  42.63 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.99 
 
 		 729 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  45.11 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  42.44 
 
 		 394 aa  233  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  41.03 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  42.12 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  41.32 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  43.02 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  39.88 
 
 		 410 aa  202  8e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  42.17 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  41.88 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  38.84 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4080  putative oxidoreductase  40.05 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.161097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  35.49 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0846  glucose sorbosone dehydrogenase  36.92 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0395822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1463  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.21 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  33.92 
 
 		 375 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  36.96 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  32.83 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2304  glucose sorbosone dehydrogenase  34.65 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  37.01 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  37.01 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  33.62 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  31.83 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0663  glucose sorbosone dehydrogenase  36.32 
 
 		 367 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  31.95 
 
 		 407 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2329  glucose sorbosone dehydrogenase  32.98 
 
 		 469 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.485013 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  35.88 
 
 		 377 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  35.12 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  32.87 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  36.25 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  37.07 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 		 390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  32.54 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2451  glucose sorbosone dehydrogenase  32.45 
 
 		 406 aa  135  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  32.43 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  34.15 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  32.85 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  32.25 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  36.25 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  35.5 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3000  glucose sorbosone dehydrogenase  32.65 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0518762  normal  0.592053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  35.47 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  36.78 
 
 		 387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  33.04 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  32.77 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  32.9 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  35.16 
 
 		 585 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  31.51 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  31.79 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0139  hypothetical protein  32.97 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2342  glucose sorbosone dehydrogenase  33.56 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00995217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  34.13 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2041  glucose sorbosone dehydrogenase  34.71 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  32.03 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  30.3 
 
 		 432 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.74 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  33.62 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  32.83 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4315  glucose sorbosone dehydrogenase  33.53 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.748634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  35.13 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  34.59 
 
 		 375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0946  glucose sorbosone dehydrogenase  28.95 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.415737  hitchhiker  0.000365484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  32 
 
 		 386 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  34.52 
 
 		 418 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2737  glucose sorbosone dehydrogenase  32.39 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 387 aa  127  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  35.13 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  33.78 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1608  hypothetical protein  33.63 
 
 		 387 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  36.32 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1872  putative soluble aldose sugar dehydrogenase  33.97 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.413591  normal  0.509919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  32.84 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  32.29 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  38.79 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  32.1 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1822  glucose sorbosone dehydrogenase  32.94 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221224  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>