294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3788 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  377  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  110  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1398  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  40.16 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  31.36 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  38.14 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  43.75 
 
 		 232 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 248 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 229 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  39.29 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  38.27 
 
 		 226 aa  48.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 271 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 173 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 245 aa  48.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 231 aa  47.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 192 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  32.76 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.76 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.76 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.76 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.76 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  32.76 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>