149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2623 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 399 aa  759    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  38.03 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0923  hypothetical protein  31.77 
 
 		 409 aa  193  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0306118  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2422  type III effector Hrp-dependent outers  38.96 
 
 		 381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.242091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  33.02 
 
 		 430 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0181  hypothetical protein  33.49 
 
 		 423 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00188424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2989  hypothetical protein  42.49 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.832553  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0177  putative inner membrane protein  33.25 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0178  hypothetical protein  33.25 
 
 		 423 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00679678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  33.25 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  34.46 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  34.46 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  34.43 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2589  type III effector Hrp-dependent protein  35.04 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  30.58 
 
 		 422 aa  123  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  33.73 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  31.55 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3566  hypothetical protein  31.14 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00898441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  32.37 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  31.91 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  27.74 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8126  type III effector Hrp-dependent outers  35.94 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302902  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.77 
 
 		 572 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  35.21 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8221  type III effector Hrp-dependent outers  31.53 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  29.41 
 
 		 572 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  28.3 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  33.74 
 
 		 440 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1143  hypothetical protein  30.93 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0564  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  31.81 
 
 		 770 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.432239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1466  type III effector Hrp-dependent outers  36.29 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  28.54 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  28.54 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  28.12 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  33.18 
 
 		 432 aa  99.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5836  hypothetical protein  31.18 
 
 		 419 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.244996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3536  type III effector Hrp-dependent outers  26.32 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  30.22 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3263  type III effector Hrp-dependent outers  33.1 
 
 		 454 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.197433  normal  0.0349209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  31.38 
 
 		 422 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  31.16 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  26 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  25.45 
 
 		 413 aa  86.7  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  26.56 
 
 		 436 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  28.02 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0524  hypothetical protein  24.86 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000260703 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6266  hypothetical protein  30.31 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  27.38 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  27.38 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2151  hypothetical protein  39.41 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  27.96 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  28.7 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  27.38 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  29.14 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  31.61 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  29.42 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  27.64 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  25.42 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  26.34 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  25.42 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  25.42 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1035  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  28.41 
 
 		 792 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  25.3 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  25.42 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  27.29 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  27.41 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  27.53 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  26.4 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  31.69 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  27.34 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  23.83 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  27.23 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  27.15 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  28.88 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  25.35 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  28.11 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  27.23 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  27.23 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1158  hypothetical protein  31.93 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  33.33 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  28.34 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  35.51 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  29.5 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  27.5 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  25.52 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3980  hypothetical protein  28.86 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  26.84 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  29.2 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  31.78 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  40.64 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  30.59 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  30.7 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  31.82 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  25.59 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  27.01 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  32.72 
 
 		 511 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  27.01 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  31.6 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  28.96 
 
 		 441 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  30.74 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>