118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5123 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5123  protein of unknown function DUF470  100 
 
 		 342 aa  679    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3230  hypothetical protein  50.15 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5764  hypothetical protein  45.05 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3619  protein of unknown function DUF470  44.04 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6311  hypothetical protein  40.87 
 
 		 345 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  25.91 
 
 		 867 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  25.99 
 
 		 867 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  24.77 
 
 		 870 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  25.91 
 
 		 869 aa  83.2  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  25.21 
 
 		 871 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  27.25 
 
 		 854 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  28.95 
 
 		 854 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  25.21 
 
 		 871 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  28.08 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  28.44 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  26.51 
 
 		 875 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  27.38 
 
 		 872 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 1118 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  26.42 
 
 		 877 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  26.42 
 
 		 877 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  27.65 
 
 		 876 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  25.3 
 
 		 880 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  25.61 
 
 		 880 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  26.72 
 
 		 863 aa  72.8  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0534  protein of unknown function DUF472  28.48 
 
 		 454 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  28.05 
 
 		 839 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  26.79 
 
 		 879 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  26.01 
 
 		 863 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  24.08 
 
 		 858 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.72 
 
 		 861 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  25.46 
 
 		 881 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  24.3 
 
 		 850 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  24.71 
 
 		 850 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  26.79 
 
 		 881 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  23.72 
 
 		 861 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  24.57 
 
 		 850 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  24.39 
 
 		 861 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  24.57 
 
 		 850 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2225  hypothetical protein  25.56 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  29.34 
 
 		 844 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  26.18 
 
 		 880 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  25.84 
 
 		 883 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  24.39 
 
 		 861 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  24.39 
 
 		 861 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  24.39 
 
 		 861 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  26.18 
 
 		 880 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  22.65 
 
 		 723 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.21 
 
 		 859 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.39 
 
 		 859 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.39 
 
 		 861 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  24.84 
 
 		 864 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  25.08 
 
 		 568 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  24.92 
 
 		 864 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  26.33 
 
 		 850 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  23.98 
 
 		 861 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  26.44 
 
 		 864 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  25.87 
 
 		 880 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  24.44 
 
 		 864 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  24.84 
 
 		 889 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  24.84 
 
 		 889 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  24.84 
 
 		 889 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  28.44 
 
 		 864 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  24.5 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  22.7 
 
 		 861 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  28 
 
 		 857 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  28.66 
 
 		 844 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  24.84 
 
 		 864 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  25.33 
 
 		 877 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  22.73 
 
 		 852 aa  64.3  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  25.36 
 
 		 880 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  24.37 
 
 		 864 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  22.55 
 
 		 850 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  25 
 
 		 866 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 1132 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  22.55 
 
 		 850 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  22.84 
 
 		 840 aa  62  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  22.26 
 
 		 850 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  22.55 
 
 		 850 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 		 1100 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  27.19 
 
 		 1101 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  22.88 
 
 		 556 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  22.88 
 
 		 556 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  25.71 
 
 		 850 aa  59.3  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  25.39 
 
 		 877 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 1113 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  20.95 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  21.28 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 1100 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  23.14 
 
 		 861 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  27.36 
 
 		 1147 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  20.72 
 
 		 875 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  24.26 
 
 		 905 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  21.22 
 
 		 862 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  22.29 
 
 		 844 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0161  hypothetical protein  26.56 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  24.92 
 
 		 896 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  23.51 
 
 		 880 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  23.51 
 
 		 880 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  21.54 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  20.68 
 
 		 556 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>