105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3619 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3619  protein of unknown function DUF470  100 
 
 		 328 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5764  hypothetical protein  44.17 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6311  hypothetical protein  43.11 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3230  hypothetical protein  41.23 
 
 		 361 aa  251  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5123  protein of unknown function DUF470  44.04 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  27.3 
 
 		 879 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  28.25 
 
 		 880 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  28.44 
 
 		 881 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  28.43 
 
 		 880 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  27.91 
 
 		 880 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  28.43 
 
 		 880 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  27.8 
 
 		 867 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  27.6 
 
 		 881 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  28.05 
 
 		 854 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  27.8 
 
 		 867 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  26.54 
 
 		 880 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  27.54 
 
 		 876 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  25.95 
 
 		 880 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  26.27 
 
 		 869 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  27.03 
 
 		 875 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  27.13 
 
 		 872 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  29.03 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  27.02 
 
 		 870 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  25.71 
 
 		 864 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2225  hypothetical protein  23.38 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  24.46 
 
 		 877 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  25.8 
 
 		 889 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  25.8 
 
 		 889 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  25.8 
 
 		 889 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  20.67 
 
 		 569 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  20.36 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  26.5 
 
 		 866 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  25.8 
 
 		 864 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  25.81 
 
 		 875 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  26.03 
 
 		 723 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  25.48 
 
 		 864 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  26.75 
 
 		 864 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  25.88 
 
 		 863 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  26.43 
 
 		 850 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  24.92 
 
 		 863 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  25.48 
 
 		 864 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  23.75 
 
 		 905 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  25.89 
 
 		 854 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  27.5 
 
 		 844 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  27.08 
 
 		 864 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  26.47 
 
 		 855 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  27.5 
 
 		 844 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0534  protein of unknown function DUF472  23.78 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  23.78 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  25.08 
 
 		 883 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  24.75 
 
 		 877 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  24.75 
 
 		 877 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  21.41 
 
 		 881 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  27.22 
 
 		 850 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  24.56 
 
 		 1118 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  25.33 
 
 		 839 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  24.06 
 
 		 850 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  24.21 
 
 		 850 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  25.57 
 
 		 852 aa  60.5  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  24.32 
 
 		 857 aa  60.5  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  25.16 
 
 		 557 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.05 
 
 		 861 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.8 
 
 		 859 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  22.75 
 
 		 861 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  23.49 
 
 		 861 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  23.49 
 
 		 861 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  23.49 
 
 		 861 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  24.06 
 
 		 850 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.8 
 
 		 859 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.49 
 
 		 861 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  26.69 
 
 		 864 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  23.05 
 
 		 861 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  24.06 
 
 		 850 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  22.7 
 
 		 872 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  21.15 
 
 		 862 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  28.38 
 
 		 896 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  22.51 
 
 		 880 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  22.51 
 
 		 880 aa  57  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  23.49 
 
 		 861 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  24.76 
 
 		 850 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0161  hypothetical protein  24.47 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5267  hypothetical protein  34.41 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  22.47 
 
 		 840 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  23.49 
 
 		 858 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  25.22 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  24.76 
 
 		 850 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  24.43 
 
 		 850 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  24.76 
 
 		 850 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  26.3 
 
 		 1132 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  22.06 
 
 		 556 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  21.58 
 
 		 861 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  22.06 
 
 		 556 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  25.12 
 
 		 847 aa  50.4  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  22.89 
 
 		 556 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  26.6 
 
 		 7149 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  23.32 
 
 		 568 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  24.34 
 
 		 871 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  24.34 
 
 		 871 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  23.74 
 
 		 851 aa  46.6  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  29.49 
 
 		 739 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>