97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4583 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4583  beta-lactamase  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15330  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  51.13 
 
 		 270 aa  252  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.499856 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0095  beta-lactamase  52.77 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21250  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  50.38 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3127  beta-lactamase  48.68 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0661  beta-lactamase  46.53 
 
 		 326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.0854039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3764  beta-lactamase  50 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3388  beta-lactamase  51.5 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3439  beta-lactamase  51.5 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00292415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3377  beta-lactamase  51.5 
 
 		 274 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.324805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0154  beta-lactamase  47.74 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1189  beta-lactamase  45.9 
 
 		 279 aa  231  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14808  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2769  beta-lactamase  48.31 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.609547  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5968  beta-lactamase  48.41 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2729  beta-lactamase  46.04 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26910  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  47.9 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.125472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12285  hypothetical protein  49.38 
 
 		 272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26900  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  47.19 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.484728  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2028  beta-lactamase  47.71 
 
 		 283 aa  205  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  28.43 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  27.53 
 
 		 364 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0229  beta-lactamase  30.26 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0888  beta-lactamase  28.63 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0244137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  34.38 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  29.34 
 
 		 637 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.92 
 
 		 635 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  26.8 
 
 		 390 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  22.12 
 
 		 379 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  27.91 
 
 		 674 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  25.73 
 
 		 351 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2964  beta-lactamase  33.7 
 
 		 380 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  25.53 
 
 		 364 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  31.34 
 
 		 507 aa  48.9  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  26.21 
 
 		 677 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  27.78 
 
 		 657 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1501  beta-lactamase  28.28 
 
 		 447 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130484  normal  0.872303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3184  beta-lactamase  36.36 
 
 		 389 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  22.15 
 
 		 395 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  28.57 
 
 		 338 aa  47  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  28.38 
 
 		 616 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  23.08 
 
 		 375 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  23.68 
 
 		 431 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  24.21 
 
 		 388 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  30.56 
 
 		 784 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  33.08 
 
 		 525 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  27.27 
 
 		 476 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  26.62 
 
 		 633 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  26.62 
 
 		 695 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  24.32 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  24.81 
 
 		 375 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  22.26 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  22.91 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  24.21 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.21 
 
 		 388 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  25.95 
 
 		 389 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  21.71 
 
 		 375 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  23.08 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.55 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  29.08 
 
 		 378 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.54 
 
 		 533 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  27.41 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  27.89 
 
 		 460 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  23.08 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  23.08 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  33.88 
 
 		 590 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  23.08 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  21.71 
 
 		 375 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.76 
 
 		 388 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  23.08 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  24.21 
 
 		 388 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  26.88 
 
 		 443 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  24.21 
 
 		 388 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  23.76 
 
 		 966 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  20.27 
 
 		 379 aa  43.5  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2834  beta-lactamase  31.36 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.764652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  25.32 
 
 		 388 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  32.65 
 
 		 447 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1900  beta-lactamase  29.2 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  24.21 
 
 		 388 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.21 
 
 		 389 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.74 
 
 		 362 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  25.17 
 
 		 445 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  27.63 
 
 		 395 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  26.91 
 
 		 790 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  24.18 
 
 		 582 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  27.86 
 
 		 372 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  24.49 
 
 		 650 aa  42.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  25.35 
 
 		 380 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  25.32 
 
 		 388 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.1 
 
 		 603 aa  42.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  23.24 
 
 		 325 aa  42.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  24.67 
 
 		 361 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  29.05 
 
 		 513 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  28.48 
 
 		 370 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  26.18 
 
 		 354 aa  42  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.87 
 
 		 401 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  27.52 
 
 		 374 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>