More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4411 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 267 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  42.27 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  40.34 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  36.64 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  40.35 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  35.5 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  38.17 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  35.83 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  39.02 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 286 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  40.55 
 
 		 264 aa  142  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 258 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  38.5 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  39.04 
 
 		 276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  38.5 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  37.44 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  37.44 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  36.84 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.84 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  36.84 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  36.84 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  36.84 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  36.84 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  36.84 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  36.16 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  40.19 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 257 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  35.39 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  35.96 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  33.61 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  34.3 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  39.63 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  34.3 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  36.4 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  36.4 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  36.4 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  36.4 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  36.4 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  34.57 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  35.32 
 
 		 265 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  36.25 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  38.6 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  37.72 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.06 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 270 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  34.07 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 261 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  32.63 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.64 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.06 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  35.83 
 
 		 254 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  34.36 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  36.2 
 
 		 266 aa  118  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 267 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  37.16 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  33.93 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  34.25 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  34.25 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  34.25 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  34.05 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  34.62 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  33.63 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  34.45 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  33.33 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 268 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  35.81 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  35.09 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  35.75 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>