More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1197 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  51.53 
 
 
736 aa  642    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  66.86 
 
 
748 aa  867    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  63.03 
 
 
767 aa  802    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  64.99 
 
 
769 aa  896    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  54.91 
 
 
770 aa  719    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  66.86 
 
 
754 aa  867    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  63.03 
 
 
767 aa  802    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  64.99 
 
 
769 aa  896    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  84.24 
 
 
743 aa  1158    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  100 
 
 
727 aa  1424    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  63.6 
 
 
1155 aa  863    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  67.3 
 
 
778 aa  884    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  63.31 
 
 
767 aa  805    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  66.62 
 
 
751 aa  906    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  59.8 
 
 
731 aa  739    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  68.01 
 
 
738 aa  939    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  50.62 
 
 
738 aa  608  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  69.74 
 
 
500 aa  588  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  45.17 
 
 
796 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  42.7 
 
 
741 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  42.59 
 
 
783 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  40.44 
 
 
733 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  42.41 
 
 
740 aa  450  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.31 
 
 
724 aa  449  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  40.38 
 
 
839 aa  428  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  40.05 
 
 
766 aa  429  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  40.14 
 
 
717 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  37.59 
 
 
710 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  39.07 
 
 
953 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  35.32 
 
 
740 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  36.8 
 
 
731 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  36.23 
 
 
1308 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  37.74 
 
 
738 aa  360  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  35.29 
 
 
805 aa  356  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  33.51 
 
 
1013 aa  352  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  33.9 
 
 
758 aa  346  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.95 
 
 
1095 aa  346  8e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  38.84 
 
 
762 aa  342  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  33.42 
 
 
944 aa  331  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  32.87 
 
 
741 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  30.47 
 
 
997 aa  318  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.42 
 
 
738 aa  300  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  34.25 
 
 
761 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11169  transmembrane transport protein mmpL13a  58.85 
 
 
361 aa  298  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266542 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.52 
 
 
730 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.52 
 
 
730 aa  290  9e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.52 
 
 
730 aa  289  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.52 
 
 
730 aa  289  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.52 
 
 
730 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.62 
 
 
730 aa  287  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.46 
 
 
730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  28.02 
 
 
729 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.25 
 
 
730 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.32 
 
 
730 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.42 
 
 
717 aa  284  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  36.28 
 
 
743 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.87 
 
 
730 aa  281  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  43.26 
 
 
773 aa  277  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  35.4 
 
 
745 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  32.96 
 
 
723 aa  269  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  33.47 
 
 
758 aa  266  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  35.21 
 
 
723 aa  266  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  36.19 
 
 
709 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  33.56 
 
 
757 aa  263  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.17 
 
 
735 aa  263  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  28.06 
 
 
829 aa  259  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  28.06 
 
 
829 aa  259  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.62 
 
 
740 aa  258  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  31.21 
 
 
758 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  32.81 
 
 
752 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.88 
 
 
983 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.88 
 
 
983 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.12 
 
 
979 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  33.82 
 
 
724 aa  253  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  32.18 
 
 
842 aa  252  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  32.15 
 
 
832 aa  251  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  33.76 
 
 
846 aa  249  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  30.91 
 
 
718 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  29.89 
 
 
743 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.15 
 
 
737 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  28.15 
 
 
704 aa  238  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  31.03 
 
 
731 aa  237  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  30.54 
 
 
734 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  31.62 
 
 
735 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  32.45 
 
 
735 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  27.4 
 
 
781 aa  230  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  31.29 
 
 
749 aa  229  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  31.16 
 
 
978 aa  229  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  31.9 
 
 
737 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  27.07 
 
 
893 aa  227  7e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  28.65 
 
 
760 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  31.51 
 
 
726 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  33.24 
 
 
751 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  34.2 
 
 
741 aa  223  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  30.94 
 
 
632 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  31.51 
 
 
755 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.13 
 
 
966 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  30.57 
 
 
734 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.92 
 
 
743 aa  219  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  30.18 
 
 
793 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>