More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0718 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 408 aa  764    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  82.84 
 
 		 408 aa  501  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  74.02 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  74.02 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  74.02 
 
 		 415 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  72.28 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  61.12 
 
 		 421 aa  391  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  60.19 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  67.57 
 
 		 411 aa  345  6e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  63.43 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  60.6 
 
 		 419 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  56.61 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  59.61 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  55.99 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  57.32 
 
 		 428 aa  301  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  51.12 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  58.25 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  54.83 
 
 		 418 aa  266  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  52.35 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  51.94 
 
 		 443 aa  242  9e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4639  amino acid permease-associated region  60.41 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  39.42 
 
 		 433 aa  202  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  37.23 
 
 		 441 aa  200  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  35.9 
 
 		 431 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  35.42 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  39.59 
 
 		 427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.98 
 
 		 489 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  31.72 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  29.7 
 
 		 500 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  30.39 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 		 549 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  32 
 
 		 745 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  30.9 
 
 		 770 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.22 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.22 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.22 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.22 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.22 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.78 
 
 		 471 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.86 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  24.64 
 
 		 542 aa  126  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 476 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 786 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 		 492 aa  123  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 471 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.43 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 490 aa  120  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.02 
 
 		 422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 496 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.92 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  33.04 
 
 		 753 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.49 
 
 		 471 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.49 
 
 		 471 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.8 
 
 		 476 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 		 461 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  30.38 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  30.83 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.21 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.24 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 		 518 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.79 
 
 		 491 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.22 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.22 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  25 
 
 		 525 aa  117  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  29.95 
 
 		 476 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  27.68 
 
 		 440 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  30.88 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  32.23 
 
 		 725 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 539 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  23.57 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 		 488 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  31.56 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 495 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 		 466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  23.57 
 
 		 471 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  28.17 
 
 		 486 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  28.17 
 
 		 486 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 510 aa  113  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 		 475 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 467 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  23.57 
 
 		 471 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 469 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  27.43 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  25.22 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  27.89 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>