More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3250 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3250  rare lipoprotein A  100 
 
 		 103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.314972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3048  rare lipoprotein A  55.34 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  53.47 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  52.17 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  52.17 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  49.47 
 
 		 221 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  48.31 
 
 		 170 aa  87.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  50.56 
 
 		 179 aa  87  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0403  hypothetical protein  48.94 
 
 		 182 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  47 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  56.41 
 
 		 324 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  38.93 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  44.57 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  64.06 
 
 		 358 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  47.25 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 171 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  62.12 
 
 		 371 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  44.57 
 
 		 195 aa  84.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  48.18 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  48.18 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  47.83 
 
 		 196 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  47.47 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  47.25 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  47.19 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  57.58 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  47.25 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  49.44 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  51.22 
 
 		 367 aa  82  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  50 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  44.57 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  51.32 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  51.32 
 
 		 360 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  45.69 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  59.09 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  40.5 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  46.81 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  56.06 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  60.94 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  46.73 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  43.48 
 
 		 335 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  47.78 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  46.59 
 
 		 314 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  47.78 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 200 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  42.39 
 
 		 342 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  42.39 
 
 		 342 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  45.65 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  43.96 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  47.83 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4774  rare lipoprotein A  41.59 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  hitchhiker  0.000486811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  41.84 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  38.84 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  43.43 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  48.86 
 
 		 442 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  44.66 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  47 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  44.57 
 
 		 408 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  46.24 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  44.21 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  42.31 
 
 		 335 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  37.17 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  46.23 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  40.22 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  41.28 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  41.84 
 
 		 341 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  37.17 
 
 		 277 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  43.1 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  43.24 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  37.17 
 
 		 277 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  37.17 
 
 		 277 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  40.43 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  51.25 
 
 		 274 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  43.48 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0451  rare lipoprotein A  56.06 
 
 		 64 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108801  normal  0.956063 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  51.25 
 
 		 274 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  42.22 
 
 		 281 aa  77.8  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  53.03 
 
 		 332 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  43.96 
 
 		 242 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  46.59 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  43.62 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  36.21 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  43.96 
 
 		 242 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  44.68 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  43.96 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  46.24 
 
 		 214 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  42.72 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  48.96 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  43.96 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  42.7 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  43.96 
 
 		 211 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>