275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0191 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 312 aa  624  1e-178  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0976  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  51.45 
 
 		 318 aa  311  9e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.888301  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  39.88 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  31.86 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  30.06 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  29.3 
 
 		 318 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  29.65 
 
 		 344 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 		 317 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  34.63 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  33.62 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  33.77 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  32.91 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  33.62 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.47 
 
 		 325 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  32.33 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  31.91 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.33 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.57 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.87 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  29.26 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.6 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  29.63 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.51 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  29.36 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  29.22 
 
 		 365 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.04 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  24.77 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  30.9 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.81 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  26.33 
 
 		 332 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.88 
 
 		 332 aa  92.8  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.67 
 
 		 325 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  28.63 
 
 		 341 aa  92.8  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.5 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  25.48 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.67 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  28.81 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  27.71 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  26.9 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.16 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  25.47 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  26.93 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.88 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.99 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  26.81 
 
 		 331 aa  86.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  24.84 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  26.09 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2072  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.54 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0241262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2556  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.85 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.370427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  24.69 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  27.54 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.67 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  27.69 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.33 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  24.38 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  31.96 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  24.53 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  24.18 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  24.07 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  23.96 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  26.05 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  23.15 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  24.84 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  23.64 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  30.47 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  30.47 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  22.45 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.73 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.46 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.41 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  26.73 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  27.71 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  30.54 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  22.77 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  24.14 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  24.4 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  23.27 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.63 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  27.71 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  22.74 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  25.11 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  23.31 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.81 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2245  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.89 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  29.76 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  25.78 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.3 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  26.73 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.58 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0740  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.03 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  25.57 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>