275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2646 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 
367 aa  756    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  67.47 
 
 
371 aa  512  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  54 
 
 
455 aa  381  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  55.43 
 
 
450 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.99 
 
 
451 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.99 
 
 
388 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.84 
 
 
388 aa  336  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.39 
 
 
427 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.17 
 
 
396 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.89 
 
 
387 aa  299  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  46.09 
 
 
422 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.58 
 
 
403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.47 
 
 
414 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.86 
 
 
392 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  44.04 
 
 
419 aa  258  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  38.87 
 
 
475 aa  255  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.82 
 
 
460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  44.03 
 
 
461 aa  252  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.56 
 
 
570 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.38 
 
 
442 aa  219  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  35.86 
 
 
482 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  35.15 
 
 
471 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.05 
 
 
520 aa  206  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  34.72 
 
 
676 aa  205  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  39.52 
 
 
400 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  32.26 
 
 
469 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  37.4 
 
 
488 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  36.24 
 
 
875 aa  176  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  30.69 
 
 
766 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  33.62 
 
 
585 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  34.87 
 
 
342 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  38.57 
 
 
748 aa  156  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  31.61 
 
 
2172 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  35.05 
 
 
1657 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  30.51 
 
 
712 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  27.7 
 
 
399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  33.43 
 
 
518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  33.55 
 
 
1029 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  29.28 
 
 
374 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.34 
 
 
374 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  27.37 
 
 
561 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  32.44 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  31.68 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  31.63 
 
 
408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  33.04 
 
 
841 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  26.23 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  27.36 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  34.39 
 
 
394 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  27.61 
 
 
370 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  36.33 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.39 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  28.45 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  29.94 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  28.16 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  27.32 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  29.91 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  25.99 
 
 
388 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  26.32 
 
 
372 aa  109  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2727  hypothetical protein  27.68 
 
 
476 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  29.27 
 
 
385 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  29.27 
 
 
385 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2753  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.64 
 
 
391 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  31.85 
 
 
972 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  29.05 
 
 
413 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  29.74 
 
 
377 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  32.96 
 
 
363 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  26.56 
 
 
530 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  29.52 
 
 
382 aa  106  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  30.03 
 
 
383 aa  106  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2581  hypothetical protein  27.66 
 
 
476 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  30.74 
 
 
385 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  25.8 
 
 
388 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  27.27 
 
 
1132 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  29.11 
 
 
407 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  28.45 
 
 
375 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  25.63 
 
 
428 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1798  hypothetical protein  41.5 
 
 
192 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2435  hypothetical protein  26.71 
 
 
476 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0561908  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  25.63 
 
 
428 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  28.41 
 
 
371 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  28.41 
 
 
371 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  28.41 
 
 
371 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  27.37 
 
 
387 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  27.37 
 
 
388 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  27.88 
 
 
378 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  28.41 
 
 
371 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  26.27 
 
 
392 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  28.41 
 
 
371 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  28.41 
 
 
371 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2449  hypothetical protein  25.94 
 
 
476 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.396913  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  28.41 
 
 
371 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  26.83 
 
 
387 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  28.41 
 
 
371 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  27.59 
 
 
377 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  33.21 
 
 
405 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  34.41 
 
 
399 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2774  hypothetical protein  26.18 
 
 
476 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2722  hypothetical protein  25.94 
 
 
476 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000210589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  28.81 
 
 
999 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>