More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1199 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1199  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 325 aa  644    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.525302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 352 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.46 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  49.58 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  40.07 
 
 		 366 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  38.9 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  39.32 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  49.38 
 
 		 347 aa  206  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  42.72 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.49 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.96 
 
 		 337 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  34.9 
 
 		 347 aa  205  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  42.29 
 
 		 353 aa  205  8e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  47.58 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  39.35 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  46.61 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  44.1 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.63 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  42.61 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  50.7 
 
 		 347 aa  202  6e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 		 346 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  41.55 
 
 		 341 aa  202  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.9 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.12 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  41.64 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  44.31 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  40.36 
 
 		 344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  40.76 
 
 		 373 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.09 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  43.69 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  40.24 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  44.84 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  42.09 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  46.03 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  41.39 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  44.26 
 
 		 329 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.85 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.46 
 
 		 408 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  39.26 
 
 		 359 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.98 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  43.17 
 
 		 373 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  42.15 
 
 		 323 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  42.14 
 
 		 347 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 		 378 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 		 378 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 		 378 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.86 
 
 		 346 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 		 378 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.49 
 
 		 373 aa  198  9e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  40.73 
 
 		 353 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  44.4 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7453  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  40.43 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  43.16 
 
 		 342 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1262  ABC transporter related  41.92 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0942202  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  39.59 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  43.15 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  46.61 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1785  ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  47.64 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  47.68 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  45.89 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.22 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.63 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1657  ABC transporter related  39.71 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4990  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.06 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.7 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0353  ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  41 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.7 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.15 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  44.12 
 
 		 371 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1821  ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1110  ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.7 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2083  ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 		 378 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 		 378 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  43.59 
 
 		 352 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0819  ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 		 378 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  38.37 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.26 
 
 		 376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  48.1 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  36.62 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  36.62 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.71 
 
 		 359 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  45.11 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 378 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.41 
 
 		 343 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  44.03 
 
 		 356 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  36.62 
 
 		 330 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 		 354 aa  196  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.73 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>