96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1127 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  485  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  51.93 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  31.07 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  37.1 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.85 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  32.4 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  29.27 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.89 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  32.61 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  32.52 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  32.52 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  31.9 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  34.33 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  30.05 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28.84 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  32 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  31.9 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  28.84 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  30.6 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2273  protein of unknown function DUF218  34.71 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  32.78 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  31.07 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  34.25 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  29.47 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  30.3 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  30.14 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  31.9 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  30.6 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  26.17 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  26.39 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  28.86 
 
 		 278 aa  52  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  31.87 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  37.23 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  29.63 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  37.23 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  31.87 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  34.08 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  31.35 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  31.97 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.59 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  27.78 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  28.12 
 
 		 196 aa  49.7  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  29.13 
 
 		 196 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  28.74 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  28.89 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.09 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  28.21 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  30.39 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  30.22 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  27.18 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  26.36 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  28.42 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  30.28 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  30.28 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  26.67 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.35 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  31.87 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.4 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  30.96 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  29.88 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  29.58 
 
 		 210 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  28.76 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  31.88 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  28.82 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  33.6 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  29.21 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  31.65 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1588  hypothetical protein  26.47 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  30.1 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1930  protein of unknown function DUF218  35.23 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000562665 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  27.12 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  35.97 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0763  hypothetical protein  29.87 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  27.69 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  25.65 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  28.05 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  32.42 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  35.88 
 
 		 176 aa  42.7  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  36.23 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  31.52 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  35.25 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  31.87 
 
 		 264 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  32.5 
 
 		 199 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  31.4 
 
 		 225 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>