More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2390 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  72.6 
 
 		 699 aa  1001    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  72.02 
 
 		 697 aa  993    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  64.47 
 
 		 681 aa  863    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  65.75 
 
 		 676 aa  845    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  72.31 
 
 		 697 aa  998    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  100 
 
 		 674 aa  1358    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  44.92 
 
 		 665 aa  537  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  43.18 
 
 		 695 aa  520  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  40.99 
 
 		 681 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  40.55 
 
 		 680 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  41.92 
 
 		 695 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  40.76 
 
 		 687 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  41.63 
 
 		 676 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  45.03 
 
 		 656 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  42.16 
 
 		 692 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  45.97 
 
 		 615 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  42.04 
 
 		 690 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  44.05 
 
 		 683 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  43.15 
 
 		 621 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  34.16 
 
 		 651 aa  330  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  33.03 
 
 		 646 aa  329  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  34 
 
 		 651 aa  329  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  33.44 
 
 		 651 aa  323  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  33.75 
 
 		 645 aa  316  8e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  31.29 
 
 		 648 aa  313  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  31.27 
 
 		 640 aa  301  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  31.25 
 
 		 640 aa  298  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  31.06 
 
 		 646 aa  294  3e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  46.18 
 
 		 569 aa  262  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  44.49 
 
 		 533 aa  242  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  34.93 
 
 		 464 aa  206  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  40.7 
 
 		 490 aa  198  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  59.18 
 
 		 287 aa  193  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  42.42 
 
 		 471 aa  184  6e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  39.18 
 
 		 468 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  30.59 
 
 		 474 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  35.54 
 
 		 577 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  32.79 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  39.18 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  42.28 
 
 		 490 aa  181  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  41.99 
 
 		 471 aa  181  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  35.54 
 
 		 577 aa  181  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  40.61 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  37.26 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  40.61 
 
 		 473 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  40.61 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  38.52 
 
 		 581 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  39.46 
 
 		 475 aa  177  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  37.76 
 
 		 477 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  37.34 
 
 		 477 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  39.85 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  36.96 
 
 		 517 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  36.13 
 
 		 741 aa  175  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.51 
 
 		 441 aa  174  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  40.33 
 
 		 472 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  36.05 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  38.67 
 
 		 480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  29.3 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.04 
 
 		 312 aa  164  6e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  39.83 
 
 		 438 aa  163  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  38.05 
 
 		 441 aa  163  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  39.09 
 
 		 429 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  43.13 
 
 		 362 aa  160  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  37.3 
 
 		 527 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  32.7 
 
 		 430 aa  159  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  37.91 
 
 		 465 aa  158  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  37.67 
 
 		 523 aa  158  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  36.91 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  36.91 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  31.15 
 
 		 460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  35.11 
 
 		 498 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  37.84 
 
 		 437 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  35.32 
 
 		 524 aa  154  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  35.22 
 
 		 470 aa  154  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  35.38 
 
 		 380 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  38.87 
 
 		 435 aa  153  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  32.05 
 
 		 490 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  35.22 
 
 		 462 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  34.72 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  29.41 
 
 		 459 aa  151  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  26.04 
 
 		 470 aa  150  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  38.03 
 
 		 429 aa  150  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  32.17 
 
 		 462 aa  150  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  36.59 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  36.64 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  35.56 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  36.4 
 
 		 439 aa  148  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  34.01 
 
 		 491 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  35.66 
 
 		 386 aa  147  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  35.25 
 
 		 386 aa  146  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  38.28 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  35.66 
 
 		 386 aa  145  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  33.2 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  36.78 
 
 		 468 aa  144  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  32.96 
 
 		 491 aa  144  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  36.78 
 
 		 468 aa  144  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  36.78 
 
 		 468 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  36.78 
 
 		 468 aa  143  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  32.96 
 
 		 482 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  33.2 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>