More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1225 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 292 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  44.16 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  44.16 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  44.32 
 
 		 306 aa  198  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  43.11 
 
 		 321 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 		 290 aa  185  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  43.59 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  43.23 
 
 		 302 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  42.49 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  44.32 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  39.71 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  41.73 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  41.88 
 
 		 278 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  38.99 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  38.99 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  38.99 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  38.1 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  44.69 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  39.71 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  38.63 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  38.63 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 		 335 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  37.55 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  39.86 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  35.53 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 		 282 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  36.3 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  38.4 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.24 
 
 		 341 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  33.45 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  37.45 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2627  alpha/beta hydrolase  35.09 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  36.17 
 
 		 295 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  34.77 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  34.41 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  32.25 
 
 		 288 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  34.41 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  34.41 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  34.41 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  35.31 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  34.77 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.96 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  32.49 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  31.41 
 
 		 323 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.23 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>