More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4169 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 412 aa  771    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  84.11 
 
 		 408 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  69.21 
 
 		 414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  55.38 
 
 		 411 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  55.12 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  55.38 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  55.38 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  51.05 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  52.17 
 
 		 405 aa  360  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  52.76 
 
 		 411 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  52.96 
 
 		 403 aa  359  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  54.29 
 
 		 409 aa  357  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  55.41 
 
 		 414 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  57.41 
 
 		 416 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  53.06 
 
 		 408 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  56.63 
 
 		 403 aa  342  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  52.96 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  52.82 
 
 		 399 aa  338  8e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  57.96 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  53.47 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  54.79 
 
 		 407 aa  336  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  53.79 
 
 		 405 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  54.14 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  53.85 
 
 		 407 aa  322  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  56 
 
 		 382 aa  318  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  49.08 
 
 		 403 aa  309  5e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  51.58 
 
 		 409 aa  308  8e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  55.24 
 
 		 411 aa  306  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  48.19 
 
 		 367 aa  305  9.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  55.88 
 
 		 411 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  47.7 
 
 		 402 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  51.86 
 
 		 420 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  47.5 
 
 		 405 aa  299  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  47.26 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  47.85 
 
 		 394 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  48.12 
 
 		 394 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  49.16 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  50.64 
 
 		 411 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  50.52 
 
 		 399 aa  288  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  48.49 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2506  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 401 aa  275  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 401 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  47.49 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03150  arabinose efflux permease family protein  50.38 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  50.82 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  45.66 
 
 		 390 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  45.66 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  45.66 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  45.66 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  45.66 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  45.5 
 
 		 422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  45.94 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  41.91 
 
 		 430 aa  252  8.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  43.01 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 391 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  44.54 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  45.62 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08020  arabinose efflux permease family protein  44.89 
 
 		 471 aa  245  8e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.923974  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 416 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 391 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 405 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14540  arabinose efflux permease family protein  47.38 
 
 		 440 aa  239  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 388 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  50.29 
 
 		 409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 391 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  43.32 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  44.94 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 391 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 		 392 aa  232  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  46.28 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  39.83 
 
 		 386 aa  230  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 400 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  44.82 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  42.32 
 
 		 388 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.2 
 
 		 388 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  43.27 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  42.03 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  42.38 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  42.74 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  44.59 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  43.49 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  41.42 
 
 		 389 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>