More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3973 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3973  ABC transporter related  100 
 
 		 282 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  58.06 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  57.02 
 
 		 267 aa  279  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  56.15 
 
 		 240 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  56.67 
 
 		 250 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  54.66 
 
 		 240 aa  278  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.47 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  56.67 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  56.67 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  54.25 
 
 		 240 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  53.31 
 
 		 263 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  54.84 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  55.06 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.25 
 
 		 244 aa  275  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  52.21 
 
 		 246 aa  275  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2698  ABC transporter related  52.33 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  53.54 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  52.63 
 
 		 239 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  54.03 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  53.44 
 
 		 240 aa  271  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.73 
 
 		 259 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  54.36 
 
 		 254 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  56.28 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  52.53 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.23 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.62 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  51.52 
 
 		 288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  56.33 
 
 		 259 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  55.02 
 
 		 265 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  53.41 
 
 		 263 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.04 
 
 		 244 aa  269  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  55.14 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  54.25 
 
 		 243 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.17 
 
 		 249 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  54.4 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  53.23 
 
 		 251 aa  268  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 		 240 aa  268  8e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  54.25 
 
 		 243 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  52.82 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.87 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.87 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  55.06 
 
 		 279 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  51.16 
 
 		 289 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.87 
 
 		 250 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.92 
 
 		 250 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  56.33 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  52.02 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  53.33 
 
 		 254 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2343  ABC transporter related  55.28 
 
 		 245 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185697  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  54.69 
 
 		 256 aa  265  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  51.16 
 
 		 289 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  53.63 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  51.94 
 
 		 260 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  51.42 
 
 		 244 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1169  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  55.47 
 
 		 250 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0517714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  53.85 
 
 		 245 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  55.95 
 
 		 256 aa  265  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5919  ABC transporter related  52.42 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.38 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  54.25 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0225  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.39 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.73407  hitchhiker  0.0063151 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.8 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  51.21 
 
 		 240 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5245  ABC transporter related  53.2 
 
 		 261 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0596713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  52.99 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  50.56 
 
 		 252 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  51.94 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  52.42 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  53.82 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  53.06 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.06 
 
 		 278 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  53.25 
 
 		 248 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.6 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.6 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  54.72 
 
 		 255 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.6 
 
 		 250 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  53.6 
 
 		 243 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  53.31 
 
 		 260 aa  261  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  53.31 
 
 		 260 aa  261  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  53.82 
 
 		 267 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  51.6 
 
 		 256 aa  261  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3878  ABC transporter  52.85 
 
 		 254 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999854  normal  0.46537 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5592  ABC transporter related  52.63 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  51.61 
 
 		 242 aa  261  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.6 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  49.8 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0240  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.99 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.773772  normal  0.21486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.02 
 
 		 267 aa  261  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  53.04 
 
 		 243 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0249  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  52.99 
 
 		 252 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  54.13 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  48.24 
 
 		 252 aa  260  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.47 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  53.2 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4341  ABC transporter related  54.03 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>